Notre objectif était de réaliser une mise au point sur les technologies de diagnostic rapide par identification génomique pour les bactériémies et d’évaluer l’intérêt de leur utilisation dans la pratique. Les différentes méthodes disponibles actuellement ont été présentées en fonction de la technologie utilisée. Il est possible également de classer ces méthodes suivant qu’elles ne permettent que des identifications (bactérienne et/ou gènes résistance aux antibiotiques) ou également une étude de la sensibilité à certains antibiotiques. Les performances de ces techniques sont très bonnes par rapport à la culture lorsque les hémocultures sont mono-microbiennes. Elles sont cependant meilleures pour les identifications (>90 %) que pour la sensibilité aux antibiotiques (>80 %). De nombreuses études ont montré l’impact positif de ces méthodes sur la réduction du délai de mise en place d’un traitement antibiotique adapté. Cependant, cette réduction de délai nécessite une organisation adéquate du laboratoire de bactériologie et l’existence d’une politique de maîtrise de l’antibiothérapie dans l’établissement. Parallèlement, l’impact sur l’évolution du patient en termes de durée d’hospitalisation ou de mortalité n’a pas été clairement démontré. Enfin, peu d’études médicoéconomiques ont été réalisées. Or, le coût de ces technologies est conséquent et leur stratégie d’utilisation doit être économiquement viable.

Our objective was to make a focus on the methods for rapid diagnosis of bacteremia by genomic identification. We also aimed to evaluate the interest of using them in the laboratory practice. The different methods currently available have been presented according to their technologic approach. It is also possible to classify these methods according to the data provided, only bacterial and/or resistance gene identification or also bacterial susceptibility to antibiotics. In case of mono-microbial blood cultures, the performances recorded with these methods are very good as compared to the subcultures on agar media. Nevertheless, they are better for identifications (>90%) than for susceptibility to antibiotics (>80%). Numerous studies demonstrated the positive impact of these methods for decreasing the time necessary to the prescription of an appropriate antimicrobial treatment. However, it is noteworthy that an appropriate organization of the laboratory and a strategy of antimicrobial stewardship in the hospital are necessary. Concurrently, the impact on the patient outcome has not been clearly demonstrated. Lastly, few medico-economic studies have been reported. However, as these methods have a substantial cost, their utilization strategy must be economically viable.