L'endoscopie avec biopsies est l'exploration de première intention en cas de symptômes évocateurs d'une pathologie œsophagienne. Elle permet le diagnostic des pathologies les plus fréquentes que sont les tumeurs (bénignes ou malignes), le reflux gastroœsophagien (RGO) et ses complications (œsophagite, œsophage de Barrett), et l'œsophagite à éosinophiles. Ses principales indications sont la dysphagie, les symptômes de RGO avec signes d'alarme ou en cas de résistance au traitement médical, les hémorragies digestives hautes et la recherche de signes d'hypertension portale. La pH-métrie et la pH-impédancemétrie œsophagiennes sont des explorations ambulatoires qui permettent de diagnostiquer un RGO dont la présentation clinique est atypique ou en cas d'échec du traitement médical, en fournissant une évaluation quantitative du reflux et en établissant une relation temporelle entre les symptômes rapportés et les épisodes de reflux enregistrés. Le recours à la pH-impédancemétrie sous traitement est privilégié chez les patients dont le reflux pathologique a été préalablement documenté. La manométrie œsophagienne permet le diagnostic des troubles moteurs de l'œsophage. Actuellement, la manométrie dite « haute résolution » est l'examen de référence permettant d'identifier les principaux troubles moteurs œsophagiens primitifs que sont l'achalasie, la maladie des spasmes de l'œsophage, l'œsophage « hypercontractile » et le péristaltisme absent. La signification des autres anomalies de la motricité œsophagienne est incertaine.