Il faut distinguer les conjonctivites du nouveau-né de celles de l'enfant car il existe des spécificités pour chaque tranche d'âge. Il faut penser aux infections sexuellement transmissibles (IST) chez le nouveau-né, à l'imperforation des voies lacrymales en cas de larmoiement quotidien du nourrisson. Chez l'enfant plus grand, les conjonctivites infectieuses nécessitent le plus souvent un traitement symptomatique et le respect des règles d'hygiène pour limiter la transmission manuportée. On aura recours aux antibiotiques locaux uniquement en cas de signes de gravité. Le traitement est empirique dans un premier temps et ne nécessite pas de prélèvement. La base du traitement des allergies est l'éviction de l'allergène et des lavages abondants.