L'imagerie fonctionnelle correspond à deux grands types de techniques : les techniques dérivées de l'imagerie par résonance magnétique (IRM) - IRM fonctionnelle essentiellement, mais aussi spectroscopie IRM, et IRM de diffusion -, et les techniques dérivées de l'imagerie nucléaire - tomographie par émission de positons (TEP) et tomographie d'émission monophotonique (TEMP), ces dernières étant désormais validées en clinique. Dans le cadre de l'épilepsie, l'imagerie fonctionnelle est utilisée dans deux principaux champs d'application : l'exploration préchirurgicale des patients pharmacorésistants (aide à la localisation du foyer épileptogène et à la planification de l'étendue du geste chirurgical) et la recherche clinique (organisation des réseaux épileptiques, meilleure compréhension de la plasticité cérébrale sous-tendue par l'épilepsie, recherche pharmacologique et neurochimique).