La mayoría de las infecciones intestinales se manifiestan por una diarrea aguda benigna que se cura espontáneamente. Cuando se sospecha una infección intestinal, sólo es necesario practicar estudios complementarios (coprocultivos, colonoscopia corta o larga) si el cuadro es muy grave, si se trata de un paciente de riesgo, si las deposiciones contienen sangre, si existe un síndrome disentérico o si la evolución del proceso es superior a 3 días. La primera medida terapéutica, y a menudo la única necesaria, es la compensación de la deshidratación. Si fuera preciso administrar un antibiótico, las fluoroquinolonas son el tratamiento de elección.

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