Les mycoses rares de l'immunocompétent susceptibles d'être observées en France métropolitaine sont essentiellement d'origine tropicale. Elles peuvent être superficielles (scytalidioses), sous-cutanées (mycétomes fongiques) ou profondes (coccidioïdomycose). En raison du développement des voyages et des migrations elles sont plus souvent observées et posent de difficiles problèmes diagnostiques et thérapeutiques. Ainsi, on ne dispose pas de traitement vraiment efficace pour les scytalidioses qui simulent cliniquement une dermatophytie. En ce qui concerne les mycétomes fongiques et les chromoblastomycoses, les traitements antifongiques sont longs, coûteux et connaissent des échecs surtout dans les formes évoluées. Ces deux mycoses n'ont pas de schéma thérapeutique reconnu. Le traitement de ces mycoses d'importation rares, sous-cutanées ou profondes repose essentiellement sur l'itraconazole mais c'est un antifongique difficile à manier en raison de son absorption très variable suivant les sujets et de ses nombreuses interactions médicamenteuses. La place de nouveaux azolés comme le voriconazole ou le posaconazole dans ces mycoses reste à définir. Pour les formes graves des mycoses profondes envisagées l'amphotéricine B liposomale est maintenant préférée à l'amphotéricine B car moins toxique, elle est en revanche plus onéreuse.