Cyclospora cayetanensis est un protozoaire parasite et l'agent étiologique de la cyclosporose, coccidiose digestive des zones tropicales et intertropicales, dont l'Homme constitue l'unique réservoir. La transmission de cette parasitose, rare en France, est liée au péril fécal et repose sur l'ingestion d'eau et/ou d'aliments souillés par les oocystes infestants. Le diagnostic de cyclosporose doit être évoqué chez tout patient présentant des diarrhées chroniques au retour d'un séjour en zone d'endémie, a fortiori s'il existe une notion de contexte épidémique et/ou d'immunodépression. Le diagnostic de certitude repose encore largement sur l'examen parasitologique des selles, après une étape de concentration et de coloration spécifique. Cette étape est indispensable du fait du nombre parfois réduit d'oocystes dans les échantillons cliniques. Les méthodes diagnostiques reposant sur la détection de l'acide désoxyribonucléique (ADN) de C. cayetanensis à partir des selles sont en plein essor et occuperont une place de plus en plus importante dans les années à venir, en particulier pour l'investigation d'épidémies. Souvent spontanément résolutive, une prise en charge thérapeutique peut parfois s'avérer utile surtout chez l'immunodéprimé qui peut présenter des formes sévères et prolongées. Dans ce contexte, le cotrimoxazole constitue le traitement de première ligne.