Les maladies héréditaires du métabolisme sont des maladies génétiques rares, le plus souvent dues au déficit d'une enzyme du métabolisme, responsable d'une accumulation de substrats en amont du blocage enzymatique et d'une carence des produits en aval. Les anomalies du métabolisme des acides aminés sont dues au déficit d'une des enzymes impliquées dans le catabolisme d'un ou de quelques acides aminés. En fonction des dérivés toxiques accumulés en amont du blocage enzymatique, on différencie les aminoacidopathies, les acidémies organiques et les déficits du cycle de l'urée. Pour la plupart de ces maladies, la mère épure les dérivés toxiques pendant la grossesse et l'intoxication débute après le clampage du cordon, expliquant l'absence de signe in utero et la notion d'intervalle libre entre la naissance et l'apparition des premiers symptômes qui peuvent être décalés jusqu'à l'âge adulte. La révélation de la maladie peut se faire par une décompensation aiguë favorisée par une situation catabolique, et/ou par une toxicité chronique, le plus souvent sur le système nerveux central. Le diagnostic repose sur la mise en évidence du dérivé toxique accumulé et doit être confirmé par le génotypage. Le traitement consiste à restaurer une activité enzymatique suffisante (transplantation hépatique ou utilisation pharmacologique de cofacteurs quand il existe une activité enzymatique résiduelle) ou à rétablir l'équilibre métabolique par une approche nutritionnelle (diminution des précurseurs des substrats toxiques et apport des produits manquants) éventuellement couplée à l'utilisation de médicaments épurateurs. Ces maladies sont rares mais justifient d'être connues car elles sont pour la plupart traitables avec un pronostic directement lié à la précocité de mise en place d'un traitement spécifique adapté. Un certain nombre d'entre elles sont accessibles au dépistage néonatal.