Abcès et fistule anale sont deux étapes d'une même maladie qui démarre par l'infection d'une glande située dans le canal anal. Les fistules sont le plus souvent idiopathiques, même si elles peuvent révéler parfois une maladie de Crohn. Le trajet infecté est le plus souvent simple et doit être traité par une chirurgie en un temps à l'exclusion de toute antibiothérapie. Le diagnostic est avant tout clinique : bombement douloureux près de l'anus pour les abcès, écoulement puriforme chronique pour les fistules. En cas d'abcès, l'objectif est de permettre l'écoulement du pus par drainage ; en cas de fistule, l'objectif est de mettre à plat le trajet infecté en partant de la porte d'entrée ou orifice primaire ; son repérage est parfois délicat. Les trajets plus complexes nécessitent une imagerie (imagerie par résonance magnétique [IRM] ou échoendoscopie) afin de guider la chirurgie et de ne pas ignorer des ramifications annexes, sources de récidives. Les deux principales complications après traitement sont la récidive et l'incontinence anale séquellaire. Pour limiter ce risque, des traitements alternatifs dits « d'épargne musculaire », sans section du muscle sphinctérien, ont été développés. Ils ont en commun un moindre risque d'incontinence mais un taux d'échec plus élevé (jusqu'à 60 % des cas).