Parmi les flagelloses intestinales, la giardiose demeure au premier plan des préoccupations des cliniciens tant par sa fréquence que par ses manifestations cliniques. En outre, l'éventail des traitements disponibles est limité et les difficultés en matière de thérapeutique sont de plus en plus fréquentes. Les flagelloses à Pentatrichomonas intestinalis, Chilomastix mesnili, Retortamonas intestinalis et Enteromonas hominis sont plus anecdotiques. Enfin, Dientamoeba fragilis trouve à l'heure actuelle sa place dans ce groupe puisqu'il a été reconnu qu'il s'agissait d'un flagellé et non pas d'une amibe.

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