Optimisation du test génétique du phéochromocytome : détection des remaniements de grande taille par QMPSF (quantitative multiplex PCR of short fluorescent fragments). - 26/03/08
N. Burnichon [1],
L. Strompf [1],
A. Venisse [1],
N. Drouot [2],
T. Frebourg [2],
P.-F. Plouin [1],
X. Jeunemaître [1],
A.-P. Gimenez-Roqueplo [1]
Voir les affiliationsIntroduction : Le phéochromocytome (PH) et le paragangliome (FPGL) fonctionnel sont des causes rares mais classiques d’HTA secondaire. Environ 25 % des PH/PGL sont génétiquement déterminés et chaque patient atteint doit bénéficier d’une enquête génétique et d’un génotypage des gènes SDHB, SDHD et VHL [1 ].
Méthodes : Nous avons récemment optimisé nos techniques de génotypage en adaptant la technique QMPSF au diagnostic génétique du PH/FPGL. En effet, l’analyse par séquençage direct des parties codantes et des jonctions introns-exons des gènes SDHs et VHL ne permet pas la détection des grands remaniements géniques alors que la QMPSF, grâce à une amplification simultanée de plusieurs amplicons en conditions quantitatives, permet leur détection. Parmi les patients atteints de PH/FPGL issus des bases de données COMETE et PGL.NET, nous avons sélectionné ceux qui présentaient des caractéristiques cliniques suggérant une forte probabilité de liaison génétique aux gènes SDHs ou VHL sur 4 critères cliniques (âge de début ≪ 35 ans, PH malin, tumeurs multiples, histoire familiale) et sur l’absence de mutation par séquençage direct.
Résultats : A ce jour, nous avons testé 96 de ces patients par QMPSF sur les gènes SDHB, SDHD et VHL. Neuf sujets ont été identifiés comme porteurs d’une large délétion (cinq sur et quatre sur VHL). Une délétion génique sur les gènes SDHs et VHL est en cause dans environ 9 % des cas de PH/FPGL sélectionnés dans cette série.
Conclusion : L’application en routine dans notre laboratoire de la technique QMPSF sur les gènes SDHs et VHL permet d’accroître les performances du test génétique du PH/FPGL. Son application à l’ensemble des patients dont la recherche de mutation par séquençage direct s’est avérée négative permettra d’estimer plus précisément la fréquence des délétions géniques de grande taille sur les quatre gènes de susceptibilité au PH sporadique.
Detection of large rearrangements in the pheochromocytomas genes using QMPSF (quantitative multiplex PCR of short fluorescent fragments): Improvement of genetic testing. |
Pheochromocytomas (PH) and functional paragangliomas (FPGL) are rare causes of secondary HTA.
About 25% of cases are genetically determined and so, genetic counselling and genetic testing are recommended for all patients with PH/FPGL. All patients should be offered screening for SDHB, SDHD and VHL mutations [1 ].
Direct sequencing allowed us to identify germline point mutations and small deletions or insertions in the SDHB, SDHD and VHL genes. However, this method is unable to detect large deletions and chromosomal rearrangements. We have now adapted the QMPSF method to detect large rearrangements of the SDHD, SDHB and VHL genes. This method is based on a simultaneous amplification of multiple amplicons and their quantitative comparison by fluorescence in test samples and in controls.
Among our cohort of patients from COMETE and PGL.NET networks, we have selected patients on clinical criteria (positive family history, multiple tumours, young age of onset ≪35 years, malignant PH) suggesting a high probability of VHL disease or of familial PH/FPGL.
For all of these patients, direct sequencing was negative.
At the present time, 96 French subjects were analyzed. Nine large deletions were found (9%), five in the SDHB gene and four in the VHL gene.
Now, in our laboratory, QMPSF will be used routinely to detect SDHs and VHL large deletions in order to improve the performance of the molecular characterization of PH/PGL.
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Vol 100 - N° 8
P. 714 - août 2007 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.