Les microbiotes bactériens colonisent les différentes cavités du corps humain et remplissent des fonctions essentielles. Ils constituent des écosystèmes complexes dont l’équilibre est constamment déplacé selon les conditions locales et environnementales. Il en résulte des variations de composition pouvant quelquefois évoluer vers des dysbioses, parfois génératrices de processus pathologiques. Les facteurs extérieurs influent particulièrement sur les microbiotes les plus exposés, tels que le microbiote cutané. Du fait des nombreuses pressions médicales et médicamenteuses, l’hôpital constitue un environnement particulier pouvant modifier les écosystèmes bactériens aussi bien à l’échelle individuelle (microbiotes des patients et des soignants) qu’à l’échelle collective (écosystèmes des services). En chirurgie notamment, les multiples pressions antibiotiques, antiseptiques et traumatiques liées à la prise en charge des patients provoquent des perturbations microbiotiques qui semblent importantes à considérer dans la physiopathologie des infections du site opératoire.

Human microbiota colonize the different niches of the human body and have essential functions. They correspond to complex ecosystems perpetually balanced by local and environmental conditions. This results in microbiota composition variations that can sometimes evolve toward dysbiosis linked with pathological processes. External factors affect particularly the most exposed microbiota, like skin microbiota. According to the many medical pressures, the hospital constitutes a particular environment, which can modify bacterial ecosystems at both individual (patient and health-care worker microbiota) and collective levels (ecosystems of hospital units). In surgical departments, the multiple aggressions (antibiotic, antiseptic and traumas) related to the management of patients induce some microbiota disturbances that seem important to consider in the pathophysiology of postoperative infections.