Des progrès considérables ont été effectués au cours des dernières années dans la prise en charge des infections fongiques, notamment grâce à l'utilisation de nouvelles thérapeutiques. L'augmentation de l'arsenal thérapeutique implique pour les praticiens de connaître précisément les caractéristiques, le mode d'administration, les effets indésirables et les indications des différents antifongiques, d'autant plus qu'ils sont fréquemment administrés à des patients ayant des comorbidités. L'amphotéricine B déoxycholate, utilisée depuis de nombreuses années, l'est maintenant moins au profit de ses formulations lipidiques, moins néphrotoxiques. Dans la classe des azolés, le voriconazole et le posaconazole se sont ajoutés au fluconazole et à l'itraconazole. Les médicaments de cette classe présentent l'avantage d'être disponibles par voie orale, mais posent des problèmes d'interactions médicamenteuses. Les échinocandines, dernière classe mise sur le marché, sont des molécules très bien tolérées, et ayant une efficacité majeure dans les candidoses. Il faut noter que, chez les patients immunodéprimés, l'épidémiologie des infections fongiques évolue, à la fois du fait du profil d'immunodépression, mais aussi du fait de l'exposition aux antifongiques. Cela souligne l'importance d'une utilisation raisonnée de ces molécules. Les recommandations des sociétés d'experts, s'appuyant sur les données de la littérature, sont utiles pour améliorer la prescription raisonnée des antifongiques.