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Les marqueurs moléculaires pour l'étude épidémiologique des infections à Legionella pneumophila - 01/01/02

C.  Nauciel,  C.  Lawrence * *Correspondance et tirés à part

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Résumé

Propos. - La légionellose est une affection souvent grave, secondaire à l'inhalation d'aérosols contaminés. L'identification de la source de contamination dans l'environnement hydrique est essentielle pour prévenir la survenue de nouveaux cas. La comparaison des souches de Legionella isolées des malades à celles isolées de l'environnement est un élément clé de l'enquête épidémiologique.

Actualités et points forts. - La comparaison des souches s'effectue actuellement surtout par des méthodes génotypiques. Certaines méthodes sont fondées sur la séparation électrophorétique de fragments d'ADN obtenus après digestion enzymatique. Lorsque les fragments sont nombreux, certains d'entre eux peuvent être visualisés par des techniques d'hybridation (ribotypage). Lorsque les fragments sont peu nombreux mais de grande taille, ils peuvent être séparés par électrophorèse en champ pulsé (méthode très reproductible). D'autres méthodes sont fondées sur l'amplification génique, comme l'AP-PCR, méthode de réalisation plus simple, mais dont la reproductiblité et le pouvoir discriminant sont moins satisfaisants. Certaines méthodes combinent clivage enzymatique et amplification génique. Enfin des méthodes fondées sur le séquençage de certains gènes sont en cours de développement.

Perspectives et projets. - La mise au point de techniques permettant de comparer rapidement des souches permet d'identifier plus rapidement l'existence de foyers épidémiques, en particulier nosocomiaux, et aide à localiser la source de contamination.

Mots clés  : Legionella pneumophila ; épidémiologie ; marqueurs génotypiques.

Abstract

Purpose. - Legionnaires' disease is due to the inhalation of contaminated aerosols. The identification of the source of contamination in the aquatic environment is necessary to prevent the occurrence of new cases. A comparative study of clinical and environmental isolates is the basis of epidemiological investigations.

Current knowledge and key points. - Genotypic methods are now mainly used to compare bacterial strains. Some of these methods are based on the electrophoretic separation of DNA restriction fragments. When electrophoretic profile are complex, some fragments can be visualized after hybridization (ribotyping). Large-sized fragments can be separated by pulsed-field gel electrophoresis. Other techniques are based on gene amplification, such as AP-PCR. This technique is easy to perform but its discriminatory power and reproducibility are lower. Some procedures are combining enzymatic cleavage and gene amplification. Finally methods based on the nucleotide sequence analysis of some genes are being evaluated.

Future prospects and projects. - Techniques enabling the rapid comparison of various Legionella isolates will permit a quick detection of outbreaks and contribute to the identification of the source of contamination.

Mots clés  : Legionella pneumophila ; epidemiology ; genotypic markers.

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Vol 23 - N° 4

P. 372-377 - avril 2002 Retour au numéro
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