Introduction – objectifs : Une méthode originale de séquençage pangénotypique des souches VHC dans la région NS3 est utilisée en virologie depuis le 1^er septembre 2011 (Besse B, J Virol Methods 2012).

Matériels et méthodes : Lors de la découverte d’une infection VHC ou lors de l’initiation d’un traitement, le génotype est déterminé par l’analyse de la séquence NS3 (site de Los Alamos). Les mutations décrites associées à une résistance au télaprévir (TPV) et/ou bocéprévir (BOC) sont recherchées à l’aide de 2 algorithmes en cours d’évaluation : Geno2Pheno HCV 1.0 et Greg+ VHC (AC 33 ANRS). En cas d’échec virologique ou de rechute sous inhibiteurs de protéase (IP), le séquençage du gène NS3 est renouvelé.

Résultats : Un traitement par trithérapie VHC avec IP a été initié entre le 1^er septembre 2011 et le 1^er septembre 2012 chez 71 patients (5 co-infectés VIH ; naïfs = 15, rechuteurs = 21, non-répondeurs = 35) : 38 TPV (26 1a et 12 1b) et 33 BOC (18 1a et 15 1b). La durée moyenne de traitement au 1^er février 2013 est de 9,1 mois. Une eRVR est obtenue chez 27 patients (71 %) sous TPV et 17 (51 %) sous BOC. Pour 41 patients, le traitement est terminé : 21 RVS, 11 succès en fin de traitement, 12 échecs virologiques (EV), 2 décès, 3 arrêts pour intolérance, 1 arrêt pour réactivation VHB, 3 perdus de vue. Parmi les 12 EV : 6 sous TPV (13 %), 5 souches G1a aux profils : V36M + R155K (n = 3), V55A (présente à J0) + V36M + R155K, R155K et 1 G1b = V36V/A ; 6 sous BOC (14 %), 2 G1b : T54S, T54T/A et 4 G1a : V36M + R155K (n = 3) et R155T.

Conclusion : Le taux élevé d’eRVR et le taux faible d’arrêt pour intolérance constituent un net progrès pour les patients infectés avec une souche VHC de génotype 1. Le génotypage NS3 permet de disposer d’une séquence de référence à J0, la comparaison avec la séquence réalisée en cas d’EV permettra de faire progresser l’algorithme.