L’étude de l’épidémiologie des infections doit permettre d’identifier le mode d’acquisition du micro-organisme responsable, les modes de transmission, la dynamique de la colonisation, et les facteurs de risque d’infection. Ce type d’étude suppose que la comparaison des souches isolées des malades et de leur environnement permette d’établir leur degré de similitude génétique. C’est dans ce cadre que se placent le développement et l’évaluation des marqueurs phénotypiques et génotypiques et la validation des stratégies de typage adaptées aux différents micro-organismes impliqués dans les infections nosocomiales et communautaires.

The study of infection epidemiology should allow to identify the mode of acquisition of microorganisms, ways of transmission, dynamic of colonization and risk factors of infection. This type of study implies that the comparison of strains isolated from patients and their environment allow establishing the degree of genetic similarity. Development and assessment of phenotypic and genotypic typing methods are essential in this framework both for community or hospital-acquired infections.