Les complications de la maladie cœliaque sont nombreuses et diverses, nutritionnelles (retard de croissance chez l’enfant, dénutrition, carences vitaminiques), hématologiques (anémie), osseuses (ostéoporose fracturaire), gynécologiques (troubles de la fécondité), cardiovasculaires (coronaropathie et thromboses veineuses), neurologiques (neuropathie périphérique), et hépatiques (cytolyse, cirrhose). La maladie cœliaque est associée à un sur-risque de maladies auto-immunes (diabète type I, thyroïdites) et surtout de cancer (cancer des voies digestives supérieures, carcinome hépatocellulaire, lymphomes). Sur le plan digestif, les principales complications sont la colite microscopique et la sprue réfractaire, marquée par une résistance au régime sans gluten. Celle-ci peut s’accompagner d’une hyperlymphocytose intraépithéliale monoclonale (sprue réfractaire de type II), véritable lymphome cryptique dont le risque évolutif est le lymphome T invasif, qui complique une maladie cœliaque sur 1000. Le régime sans gluten à vie protège en grande partie de la survenue de la plupart des complications et corrige la surmortalité associée aux complications.

Numerous complications can occur in celiac disease, nutritional (growth failure in children, malnutrition, vitamin deficiencies), hematologic (anaemia), bone disease (osteoporosis, fracture), gynaecologic (hypo fertility), cardiovascular (coronaropathy, venous thrombosis), neurological (peripheral neuropathy), hepatic (cytolysis, cirrhosis). Celiac disease is associated with an increased risk of autoimmune diseases (type 1 diabetes, thyroiditis), and cancer (upper digestive tract, hepatocellular carcinoma, lymphoma). The main digestive complications are microscopic colitis and refractory sprue, which are resistant to gluten-free diet. It can be associated with a monoclonal proliferation of intraepithelial lymphocytes (type 2 refractory sprue), which may be considered as a cryptic lymphoma and can lead to invasive T lymphoma, which occurs in one celiac patient in 1000. Gluten-free diet protects from the occurrence of most complications and correct the over-mortality related to these complications.