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Mise en place d’un secteur de pathologie moléculaire en oncologie au sein d’un laboratoire d’anatomie pathologique (LPCE, CHU de Nice) - 05/03/13

Doi : 10.1016/j.annpat.2012.12.003 
Elodie Long a, 1, Véronique Hofman a, b, 1, Marius Ilie a, Virgine Lespinet a, Christelle Bonnetaud b, Olivier Bordone b, Virginie Gavric-Tanga b, Kevin Washetine a, Marie-Clotilde Gaziello a, b, Virginie Mauro b, Sandra Lassalle a, Eric Selva b, Katia Zahaf a, José Santini c, Laurent Castillo c, Jean-Philippe Lacour d, Nicolas Vénissac e, Jérôme Mouroux e, Josiane Otto f, Michel Poudenx g, Charles-Hugo Marquette g, Jean-Christophe Sabourin h, Paul Hofman a, , b, 1
a Laboratoire de pathologie clinique et expérimentale (LPCE), hôpital Pasteur, centre hospitalo-universitaire, BP 69, 06002 Nice, France 
b Tumorothèque-centre de ressources biologiques, hôpital Pasteur, centre hospitalo-universitaire, BP 69, 06002 Nice, France 
c Institut universitaire de la face et du cou, avenue de Valombrose, 06100 Nice, France 
d Service de dermatologie, hôpital de l’Archet, 06200 Nice, France 
e Service de chirurgie thoracique, hôpital Pasteur, centre hospitalo-universitaire, BP 69, 06002 Nice, France 
f Unité de pneumologie, CLCC Antoine-Lacassagne, 06189 Nice, France 
g Service de pneumologie, hôpital Pasteur, centre hospitalo-universitaire, BP 69, 06002 Nice, France 
h Laboratoire de pathologie, CHU de Rouen, 1, rue de Germont, 76031 Rouen cedex, France 

Auteur correspondant.

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Résumé

L’avènement des thérapies ciblées et de la médecine personnalisée en oncologie a provoqué en France la mise en place et la structuration du réseau des plateformes hospitalières de génétique moléculaire sous l’impulsion de l’Institut national du cancer (INCa). Ces plateformes sont, selon les sites concernés, intégrées ou non au sein des services d’anatomie pathologique. Le développement des techniques de biologie moléculaire, le choix des procédures, l’établissement du circuit des échantillons, le contrôle de la qualité et la sélection des altérations génomiques à détecter sur chaque plateforme, ont été laissés à l’appréciation des différents laboratoires. En fonction des appels à projet formulés par l’INCa, les plateformes hospitalières de génétique moléculaire ont pu adapter leur activité selon l’enveloppe budgétaire attribuée. Alors que la présence de certaines altérations génomiques (comme les mutations du gène KRAS dans les adénocarcinomes coliques métastatiques ou les mutations du gène de l’EGFR dans les adénocarcinomes bronchopulmonaires), peuvent avoir comme conséquence l’administration de thérapies ciblées associée à une autorisation de mise sur le marché (AMM) de différentes molécules, d’autres sont associées à des essais thérapeutiques. Dans ce contexte, il est apparu nécessaire d’adapter rapidement le fonctionnement des laboratoires hospitaliers d’anatomie pathologique réalisant des actes de biologie moléculaire afin de répondre à la demande croissante des oncologues dans le domaine des thérapies ciblées. Cet article a pour but de décrire les différentes étapes de la mise en place d’un secteur de pathologie moléculaire au sein d’un laboratoire hospitalier d’anatomie pathologique (LPCE, CHU de Nice) et de montrer l’expérience dans ce domaine de ce laboratoire plus particulièrement orienté sur la prise en charge du diagnostic morphologique et moléculaire des cancers du poumon, de la thyroïde et du mélanome malin.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

The advent of targeted therapies and personalized medicine in oncology has led in France to the settlement and organisation of a network of hospital molecular genetic platforms under the impetus of the National Cancer Institute (INCa). These platforms are, according to the concerned sites, integrated or not in pathology laboratories. The development of molecular biology methods, the choice of the procedures, the establishment of sample workflow, the quality control and the selection of the genomic alterations to be detected on each platform, have been left to the discretion of the different laboratories. Based on calls for project made by the INCa, hospital molecular genetic platforms were able to adapt their activity according to the assigned budgets. While the presence of some genomic alterations (i.e. KRAS gene mutations in metastatic colon adenocarcinoma or EGFR gene mutations in lung adenocarcinomas), may lead to administration of targeted therapies under the Marketing Authorization Application (MAA), others are associated with therapeutic clinical trials. However, increasing number of MAA for new molecules targeting genomic alterations is likely in the near future. In this context, it is necessary to quickly adapt the organisation of work of the hospital pathology laboratories performing molecular biology tests in order to meet the growing demand of oncologists in the field of targeted therapies. The purpose of this article is to describe the different steps of the settlement of a molecular genetic platform in an academic pathology laboratory (LPCE, CHU de Nice) and to show the experience of this laboratory specifically oriented on the support of the morphological and molecular diagnosis of lung cancer, thyroid cancer and malignant melanoma.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Biologie moléculaire, Pathologie moléculaire, Assurance qualité, Accréditation, NF ISO 15189:2007, Thérapie ciblée

Keywords : Molecular biology, Molecular pathology, Quality assurance, Accreditation, ISO 15189, Targeted therapy


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Vol 33 - N° 1

P. 24-37 - février 2013 Retour au numéro
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  • Accréditation de l’activité de pathologie moléculaire selon la norme ISO 15189. Principales étapes à respecter et principaux écueils possibles
  • Élodie Long, Véronique Hofman, Marius Ilie, Kevin Washetine, Virgine Lespinet, Christelle Bonnetaud, Olivier Bordone, Virginie Gavric-Tanga, Marie Clotilde Gaziello, Sandra Lassalle, Éric Selva, Katia Zahaf, Aude Lamy, Jean-Christophe Sabourin, Paul Hofman
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