Meta-analysis of character utility and phylogenetic information content in cladistic studies of ammonoids - 01/03/12

Doi : 10.1016/j.geobios.2011.11.010 
Margaret M. Yacobucci
Department of Geology, 190 Overman Hall, Bowling Green State University, Bowling Green, Ohio, 43403 USA 

Corresponding author. Tel.: +1 419 372 7982; fax: +1 419 372 7205.

Abstract

While previous workers have argued persuasively that ammonoid workers should use cladistic approaches to reconstruct phylogeny, relatively few cladistic studies have been published to date. An essential yet challenging part of cladistic analysis is the selection of characters. Are certain types of characters more likely to show homoplasy? Are certain aspects of shell anatomy more likely to contain phylogenetically informative characters? Are datasets with more characters inherently better? To answer these questions, a meta-analysis of character data from published ammonoid phylogenies was performed. I compiled 14 datasets, published between 1989 and 2007, representing parsimony-based phylogenetic analyses of ammonoids. These studies defined a combined total of 323 characters, which were grouped into categories reflecting different aspects of anatomy: shell size and shape, ornament, suture, early ontogeny, body chamber and apertural modifications. Tree searches were re-run to determine overall tree statistics, parsimony permutation tail probability (PTP) tests were calculated to assess the phylogenetic information content of the matrices, and retention and rescaled consistency indices for each character were calculated. My analyses revealed that studies with higher character/taxon ratios did not necessarily produce trees with more information content and less homoplasy, as measured by retention or rescaled consistency indices, because additional characters were often parsimony-uninformative. Rather, studies with relatively few characters could produce high-quality trees if the characters were well-chosen and character states carefully defined. Characters related to the body chamber and adult aperture typically had retention indices of either 0 or 1, rarely in between, indicating that they either worked perfectly or not at all. Suture characters tended to have higher indices than shell shape or ornament characters, suggesting more phylogenetic information and less homoplasy in the suture line than in shell traits. These results should aid in the selection of characters for future cladistic studies of ammonoids.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Ammonoid, Cephalopod, Morphology, Evolution, Phylogenetics, Cladistics


Plan


 Corresponding editor: Isabelle Rouget.


© 2011  Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 45 - N° 1

P. 139-143 - janvier 2012 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Preferential predatory peeling: Ammonoid vs. nautiloid shells from the Upper Carboniferous of Texas, USA
  • Ryoji Wani, Robert G. Jenkins, Royal H. Mapes
| Article suivant Article suivant
  • Cephalopod and brachiopod fossils from the Pacific: Evidence from the Upper Cretaceous of the Magellan Seamounts
  • Yuri D. Zakharov, Mikhael E. Melnikov, Alexander M. Popov, Sergej P. Pletnev, Vladimir D. Khudik, Tatiana A. Punina

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

Déjà abonné à cette revue ?

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2025 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.