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Informatics resources for tuberculosis – Towards drug discovery - 21/02/12

Doi : 10.1016/j.tube.2011.08.006 
Jagadish Chandrabose Sundaramurthi a, S. Brindha b, T.B.K. Reddy c, Luke Elizabeth Hanna a,
a ICMR-Biomedical Informatics Centre, Tuberculosis Research Centre (ICMR), Chennai 600031, India 
b Department of Biochemistry, University of Madras, Guindy Campus, Chennai 600025, India 
c Department of Biochemistry, Stanford University, CA 94305, USA 

Corresponding author. Dept. of Clinical Research, Tuberculosis Research Centre, Mayor VR Ramanathan Road, Chetput, Chennai 600 031, India. Tel.: +91 44 28369597; fax: +91 44 28362528.

Summary

Integration of biological data on gene sequence, genome annotation, gene expression, metabolic pathways, protein structure, drug target prioritization and selection, has resulted in several online bioinformatics databases and tools for Mycobacterium tuberculosis. Alongside there has been a growth in the list of cheminformatics databases for small molecules and tools to facilitate drug discovery. In spite of these efforts there is a noticeable lag in the drug discovery process which is an urgent need in the case of emerging and re-emerging infectious diseases. For example, more than 25 online databases are available freely for tuberculosis and yet these resources have not been exploited optimally. Informatics-centered drug discovery based on the integration and analysis of both bioinformatics and cheminformatics data could fill in the gap and help to accelerate the process of drug discovery. This article aims to review the current standing of developments in tuberculosis-bioinformatics and highlight areas where integration of existing resources could lead to acceleration of drug discovery against tuberculosis. Such an approach could be adapted for other diseases as well.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Tuberculosis, Bioinformatics, Cheminformatics, Database, Drug discovery


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Vol 92 - N° 2

P. 133-138 - mars 2012 Retour au numéro
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  • The ins and outs of Mycobacterium tuberculosis protein export
  • Lauren S. Ligon, Jennifer D. Hayden, Miriam Braunstein
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  • Identification of Rv0535 as methylthioadenosine phosphorylase from Mycobacterium tuberculosis
  • Kajal Buckoreelall, Yanjie Sun, Judith V. Hobrath, Landon Wilson, William B. Parker

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