S'abonner

Rapid identification of bacteria, mecA and van genes from blood cultures - 05/11/07

Doi : 10.1016/j.patbio.2007.07.011 
M.-F. Prère a, b, , O. Baron a, b, O. Fayet b
a Unité de bactériologie pédiatrique, IFB, CHU de Toulouse, France 
b Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires, CNRS-LMGM-UMR5100, université Paul-Sabatier, 118, route de Narbonne, Toulouse 31062 cedex 09, France 

Corresponding author.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

pages 3
Iconographies 1
Vidéos 0
Autres 0

Abstract

The Genotype technology, a quick molecular genetic assay based on DNA multiplex amplification with biotinylated primers followed by hybridization to membrane bound probes, complies with the requirements for a fast diagnosis of sepsis. We evaluated the new Genotype®BC Gram-negative and Gram-positive test kits (Hain Life Science, Germany) which respectively allow for the identification of 15 species of Gram-negative (GN) rods, and the identification of 17 Gram-positive (GP) bacteria species together with the determination of methicillin and vancomycin resistance (mecA and van genes). The study was performed on 60 positive blood cultures from BacT/ALERT bottles (aerobic, anaerobic and pediatric bottles). First, a Gram stain was carried out to select between Genotype®BC GP or GN test, then identification were performed by the Genotype®BC tests and by biochemical conventional tests after subculture and phenotypic susceptibility determination. The operating procedure was very easy to carry out and required a small amount of starting material (5 to 10 μL of blood culture). The results were available within 4.5 hours. For all the blood cultures, the Genotype®BC results correlated with the biochemical identification and phenotypic antibiotics susceptibility. According to our results, this DNA strip technology based assay can easily be incorporated into routine diagnosis.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

La technologie du test Génotype, un système d'identification génique basé sur une amplification multiple d'ADN avec des amorces biotinylées suivies d'une hybridation aux sondes fixées sur membrane, répond aux exigences d'un diagnostic rapide dans le cadre des septicémies. Nous avons évalué les deux nouveaux tests Génotype®BC (Hain Life Science, Germany, Biocentric) qui permettent l'identification de 15 espèces de bacilles Gram-négatifs (GN) ou de 17 Gram-positifs (GP) et de plus la détermination de la résistance à la méthicilline et la vancomycine (gènes mecA et van) dans une seule étape. L'étude a été réalisée sur 60 flacons d'hémocultures BacT/ALERT de type aérobie, anaérobie ou pédiatrique. Dans un premier temps une coloration de Gram a été effectuée pour le choix du test GN ou GP; puis l'identification a été réalisée à la fois par le test Génotype et, après subculture, par les techniques biochimiques classiques ainsi que par la détermination phénotypique de la sensibilité à la méthicilline et la vancomycine. La manipulation s'est avérée très facile, ne demandant que 5 à 10 μL de bouillon de culture. Le temps nécessaire pour obtenir les résultats était de 4,5 heures environ. Pour toutes les hémocultures, les résultats obtenus avec le test Génotype®BC correspondaient à ceux attendus. La méthode des tests Génotype® de bandelette d'hybridation d'ADN peut être facilement incorporée à la panoplie des tests de routine.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Gram-positive and Gram-negative bacteria PCR identification, Genotype®BC test, Identification directly from blood culture bottles, Multiplex PCR, DNA strip system

Mots clés : Identification par PCR des bactéries Gram-positif et Gram-négatif, Identification bactérienne directement à partir des flacons d'hémocultures, PCR multiple, Système de bandelette ADN, Test Génotype®BC


Plan


© 2007  Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 55 - N° 8-9

P. 375-377 - novembre 2007 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Infections à Staphylococcus aureus porteurs du gène codant la leucocidine de Panton-Valentine à l'hôpital : quel statut donner à ces souches ?
  • S. Cadé, V. Foissaud, C. Bigaillon, J.-L. Koeck, P. Dubrous, V. Hervé, C. Soler
| Article suivant Article suivant
  • Évaluation du test IDI-MRSA sur une collection de souches de Staphylococcus aureus résistants à la méticilline d'acquisition communautaire et sur des prélèvements de portage
  • N. Liassine, F. Decosterd, J. Étienne

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’achat d’article à l’unité est indisponible à l’heure actuelle.

Déjà abonné à cette revue ?

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2024 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.