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Genotypic analysis of Salmonella enterica serovar Typhi collected during two successive autumnal typhoid outbreaks in southeast Tunisia - 26/09/07

Doi : 10.1016/j.patbio.2007.03.006 
N. Ben Saida a, S. Mhalla a, N. Bouzouïa b, J. Boukadida a,
a Laboratoire de microbiologie-immunologie (UR 16/02), CHU Farhat-Hached, avenue Ibn-Jazzar, 4001 Sousse, Tunisia 
b Service des maladies infectieuses, CHU Fattouma-Bourguiba, Monastir, Tunisia 

Corresponding author.

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Abstract

Objective

Investigation of two successive autumnal outbreaks of typhoid fever that occurred in southeast Tunisia.

Patients and methods

Salmonella typhi isolates collected from confirmed cases of typhoid fever during the two outbreaks occurred in autumn 2004 and 2005 and from healthy carriers were analyzed by antibiogram and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE).

Results

A total of 86 isolates of Salmonella enterica serovar Typhi (76 from blood culture or stool of patients involved in both outbreaks and 10 from stool of healthy carriers) were obtained. All isolates of S. typhi were fully sensitive to all antibiotics tested, particularly to co-trimoxazole and ciprofloxacin. All isolates of 2004 (39 from patients and 10 from healthy carriers) appeared to be genetically identical when digested with SpeI, AvrII and XbaI. XbaI digestion of 2005 outbreak isolates gave five different patterns with predominance of the 2004 outbreak pattern. Both outbreaks were concomitant with the season of “legmi”, fermented juice traditionally extracted from palm-tree.

Conclusion

PFGE with XbaI was discriminatory and can be useful for epidemiological routine investigation of typhoid fever. Typing results suggests the monoclonality of 2004 outbreak and the multiclonality of the 2005 outbreak. The epidemic clone of S. typhi is able to persist for long period in a quiet state in the population and to give again a new outbreak, when the conditions become favorable.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Objectif

Investigation épidémiologique de deux épidémies successives automnales de fièvre typhoïde survenues dans le sud tunisien et impliquant 39 et 37 patients respectivement.

Matériel et méthodes

Les isolats de Salmonella typhi collectés à partir des cas confirmés de fièvre typhoïde au cours de deux épidémies (2004 et 2005) ainsi que ceux collectés à partir des porteurs sains ont été analysés par antibiogramme et par électrophorèse en champs pulsés.

Résultats

Quatre-vingt-six isolats de S. typhi (76 provenant des patients des deux épidémies et dix provenant des porteurs sains) ont été collectés. Toutes les souches de S. typhi étaient sensibles à l'ensemble des antibiotiques testés en particulier au cotrimoxazole et à la ciprofloxacine. Tous les isolats de l'épidémie 2004, (39 obtenus à partir des patients et dix obtenus à partir de dix porteurs asymptomatiques), ont exprimé un génotype identique après digestion par SpeI, ou AvrII ou par XbaI. La digestion avec XbaI des isolats de l'épidémie 2005 a donné cinq génotypes différents avec la prédominance du génotype de l'épidémie 2004. Les deux épidémies étaient concomitantes avec la saison du «legmi», jus fermenté de palmier extrait de manière traditionnelle.

Conclusion

Le pulsotype de S. typhi généré par XbaI est un outil fiable et puissant pour l'exploration épidémiologique de la fièvre typhoïde. Notre étude a montré l'habilité du clone épidémique de S. typhi à persister dans la population pendant une longue période à l'état quiescent pour redonner, quand des conditions épidémiologiques deviennent favorables, une nouvelle épidémie.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Outbreak, Salmonella enterica serovar Typhi, Southeast Tunisia, Pulsed-field gel electrophoresis

Mots clés : Épidémies, Salmonella enterica serovar Typhi, Sud tunisien, ECP


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Vol 55 - N° 7

P. 336-339 - septembre 2007 Retour au numéro
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