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Transcriptional responses of host peripheral blood cells to tuberculosis infection - 10/09/11

Doi : 10.1016/j.tube.2011.07.002 
Emil Lesho a, , Francisco J. Forestiero b, Mario H. Hirata b, Rosario D. Hirata b, Leticia Cecon b, Fernando F. Melo c, Sun H. Paik d, Yoko Murata d, Earl W. Ferguson d, Zhining Wang e, Guck T. Ooi d
a Walter Reed Army Institute of Research, 503 Robert Grant Avenue, Silver Spring, MD 20910, USA 
b School of Pharmaceutical Sciences, University of Sao Paulo, Sao Paulo, SP, Brazil 
c Clemente Ferreira Institute, Sao Paulo, SP, Brazil 
d Sun BioMedical Technologies Inc., Ridgecrest, CA 93555, USA 
e SRA International, Inc., National Cancer Institute at the National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA 

Corresponding author. Tel.: +1 301 319 9302; fax: +1 301 319 9801.

Summary

Host responses following exposure to Mycobacterium tuberculosis (TB) are complex and can significantly affect clinical outcome. These responses, which are largely mediated by complex immune mechanisms involving peripheral blood cells (PBCs) such as T-lymphocytes, NK cells and monocyte-derived macrophages, have not been fully characterized. We hypothesize that different clinical outcome following TB exposure will be uniquely reflected in host gene expression profiles, and expression profiling of PBCs can be used to discriminate between different TB infectious outcomes. In this study, microarray analysis was performed on PBCs from three TB groups (BCG-vaccinated, latent TB infection, and active TB infection) and a control healthy group. Supervised learning algorithms were used to identify signature genomic responses that differentiate among group samples. Gene Set Enrichment Analysis was used to determine sets of genes that were co-regulated. Multivariate permutation analysis (p < 0.01) gave 645 genes differentially expressed among the four groups, with both distinct and common patterns of gene expression observed for each group. A 127-probeset, representing 77 known genes, capable of accurately classifying samples into their respective groups was identified. In addition, 13 insulin-sensitive genes were found to be differentially regulated in all three TB infected groups, underscoring the functional association between insulin signaling pathway and TB infection.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Tuberculosis, Microarray analysis, Genes, Peripheral blood cells, Insulin signaling


Plan


 Data in this manuscript have been presented in part at the 58th Annual Meeting of the American Society of Tropical Medicine and Hygiene, November 2009, Washington, D.C.


© 2011  Publié par Elsevier Masson SAS.
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Vol 91 - N° 5

P. 390-399 - septembre 2011 Retour au numéro
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  • Strain-dependent CNS dissemination in guinea pigs after Mycobacterium tuberculosis aerosol challenge
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