Stachybotrys chartarum est un champignon toxigénique, responsable de pathologies parfois graves. Les méthodes de détection fondées sur l'identification et la numération des conidies par examen microscopique, ou sur la numération des colonies après culture, sont longues, fastidieuses et manquent de sensibilité. L'objectif de notre étude est d'évaluer la PCR en temps réel (PCR-tr) pour la détection de S. chartarum dans l'environnement.

S. chartarum est recherché par PCR-tr dans 76 prélèvements : 1) des prélèvements d'air (n=15) et de foin (n=30) en milieu agricole ; 2) des prélèvements d'air (n=3) et de surface (n=5) en milieu domestique ; 3) des prélèvements d'air (n=2) et de surface (n=13) dans un service d'hématologie.

S. chartarum est détecté dans 4/76 prélèvements par la culture et dans six prélèvements supplémentaires (soit 10/76) par la PCR-tr. La PCR-tr permet d'obtenir un seuil de détection dans l'air d'environ 40 spores/m³. S. chartarum n'a pas été détecté en milieu agricole. En milieu domestique, la présence de S. chartarum sur les cultures est confirmée par la PCR-tr. En milieu hospitalier, la quantification de l'ADN de S. chartarum par PCR-tr permet de localiser l'origine de la contamination d'une chambre d'hospitalisation à partir d'un placard technique détérioré par une fuite d'eau.

La PCR-tr est une méthode rapide qui permet de quantifier S. chartarum dans les prélèvements environnementaux. L'application de cette méthodologie à la détection d'autres moisissures (Aspergillus; mucorales, Penicillium, Cladosporium), pourrait représenter un outil important pour la surveillance de l'aérocontamination fongique en milieu hospitalier et domestique.

Stachybotrys chartarum is a toxigenic mould that could be responsible for severe illness. Detection and quantitative measurement of S. chartarum conidia in environmental samples using direct microscopic examination or culture methods were labour intensive and time consuming, and have a low sensibility. The aim of our study was to evalue the real-time PCR for S. chartarum detection in indoor building, agricultural and hospital environments.

Detection of S. chartarum using real-time PCR was performed in 76 samples: 1) air samples (N=15) and hay samples (N=30) from farmer environment; 2) air samples (N=3) and surface samples (N=5) from indoor buildings; 3) air samples (N=2) and surface samples (N=13) from a hematology unit.

S. chartatum was detected in 4/76 samples using culture method and in 6 additional samples (i.e. 10/76) using real-time PCR. Detection limit in air samples was about 40 spores/m³ using real-time PCR. S. chartarum was not detected in farmer environment. In indoor building samples, culture data were confirmed by real-time PCR results. In the hematology unit, real-time PCR results help to identify the source of contamination of a patient room from a water damaged technical local.

Real-time PCR was a rapid method for S. chartarum quantitative measurement in environmental samples. Real-time PCR detection of other indoor moulds (Aspergillus, mucorales, Penicillium, Cladosporium) could be useful for fungal environmental control in indoor buildings and in hospital units.