Identification rapide de Mycobacterium tuberculosis complex dans les échantillons respiratoires par amplification d'ARN en temps réel - 06/12/06
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Résumé |
La fiabilité et la rapidité du diagnostic biologique de la tuberculose sont importantes pour entreprendre un traitement adapté chez tout patient suspect de tuberculose active, et mettre en place les mesures d'isolement indispensables pour prévenir la transmission de la maladie. Ces dernières années, de nombreux tests de biologie moléculaire ont été évalués dans le but d'identifier directement Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) dans les prélèvements respiratoires, mais nécessitent au moins quatre heures pour être réalisés. Un nouveau procédé permettant, en moins d'une heure, l'amplification et la détection en temps réel de l'ARNr 16S de MTB par une technique de transcription inverse (TRC: Transcription Reverse transcription Concerted - TRCRapid M. tuberculosis - Tosoh Bioscience, Tokyo, Japon) directement dans les échantillons respiratoires a été testé dans notre laboratoire. Au total, 319 échantillons respiratoires ont été testés dans cette étude préliminaire et les résultats ont été comparés à l'examen microscopique et à la culture. Quatorze échantillons ont eu une culture positive à MTB. Parmi ces derniers, l'examen microscopique était positif dans 11 cas (78,6 %) et les résultats du procédé TRC étaient positifs dans huit cas (57,1 %). La sensibilité globale du test a été de 73 % en comparaison aux échantillons ayant une culture positive à MTB et un examen microscopique positif à la fois. Cette étude préliminaire montre qu'il est possible d'identifier rapidement MTB (en moins de deux heures pour 14 échantillons et en moins d'une heure pour un échantillon) dans la plupart des échantillons présentant un examen microscopique positif à l'aide de réactifs simples d'utilisation et prêts à l'emploi. Un nouveau procédé de prétraitement et de nouveaux réactifs d'extraction pour améliorer la stabilité de l'ARN dans les échantillons respiratoires et augmenter l'efficacité de l'extraction est actuellement en cours d'évaluation dans notre laboratoire.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Abstract |
Rapid and sensitive detection of Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) directly on clinical respiratory specimens is essential for a correct management of patients suspected of tuberculosis. For this purpose PCR-based kits are available to detect MTB in respiratory specimen but most of them need at least 4 hours to be completed. New methods, based on TRC method (TRC: Transcription Reverse transcription Concerted - TRCRapid M. Tuberculosis - Tosoh Bioscience, Tokyo, Japon) and dedicated monitor have been developed. A new kit (TRC Rapid M. tuberculosis and Real-time monitor TRCRapid-160, Tosoh Corporation, Japan) enabling one step amplification and real-time detection of MTB 16S rRNA by a combination of intercalative dye oxazole yellow-linked DNA probe and isothermal RNA amplification directly on respiratory specimens has been tested in our laboratory. 319 respiratory specimens were tested in this preliminary study and results were compared to smear and culture. Fourteen had a positive culture for MTB. Among theses samples, smear was positive in 11 cases (78,6%) and TRC process was positive in 8 cases (57,1%). Overall sensitivity of TRC compared to smear positive samples is 73%. Theses first results demonstrated that a rapid identification of MTB was possible (less than 2 processing hours for 14 specimens and about 1 hour for 1 specimen) in most cases of smear positive samples using ready to use reagents for real time detection of MTB rRNA in clinical samples. New pretreatment and extraction reagents kits to increase the stability of the sputum RNA and the extraction efficiency are now tested in our laboratory.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : Tuberculose pulmonaire, Diagnostic rapide, PCR temps réel, Échantillons respiratoires
Keywords : Pulmonary tuberculosis, Rapid diagnosis, Real-time PCR, Respiratory specimen
Plan
Vol 54 - N° 8-9
P. 518-522 - octobre-novembre 2006 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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