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Application de marqueurs génotypiques dans l'investigation de deux épidémies d'infections nosocomiales àSalmonella Livingstone dans le CHU de Sfax, Tunisie - 01/01/06

Doi : 10.1016/j.patbio.2006.02.003 
S. Ktari a, c, F. Mahjoubi a, c, S. Jaoua b, A. Karray e, N. Marty d, S. Ben Redjeb c, A. Hammami a,
a Laboratoire de microbiologie, faculté de médecine de Sfax, CHU Habib-Bourguiba de Sfax, Tunisie 
b Centre de biotechnologie de Sfax, Sfax, Tunisie 
c Laboratoire de recherche sur les résistances aux antibiotiques, Tunis, Tunisie 
d Laboratoire de bactériologie-hygiène, hôpital Rangueil, Toulouse, France 
e Service de pédiatrie, CHU Hédi-Chaker de Sfax, Tunisie 

Auteur correspondant.

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Résumé

But de l'étude. - Investigation de deux épidémies d'infections nosocomiales à Salmonella Livingstone dans le service de pédiatrie de Sfax en utilisant différents marqueurs épidémiologiques.

Matériel et méthodes. - Notre étude a porté sur 84 souches de S. Livingstone isolées chez des malades hospitalisés dans le service de pédiatrie de Sfax entre novembre 1999 et août 2002 et une souche isolée au niveau de l'environnement de ce service. Trois souches contrôle de S. Livingstone épidémiologiquement non liées ont été incluses. Les marqueurs épidémiologiques utilisés étaient : analyse du profil plasmidique, ERIC-PCR, RAPD-PCR et électrophorèse en champ pulsé.

Résultats. - L'analyse du profil plasmidique et l'ERIC-PCR ont généré des profils semblables pour les souches isolées du service de pédiatrie de Sfax y compris celle de l'environnement, alors que les souches de contrôle avaient des profils différents. La RAPD-PCR appliquée sur un échantillon de 20 souches a montré trois génotypes avec prédominance d'un profil qui était le seul retrouvé en 2002. Nos souches de S. Livingstone, en dehors de la souche vétérinaire, étaient non typables par l'électrophorèse en champ pulsé.

Conclusion. - Au bout de ce travail, nous avons pu confirmer l'identité des souches responsables de deux épidémies. L'identification de la source de contamination et l'amélioration des conditions d'hygiène s'imposent.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

Objective. - The aim of the study was to investigate two nosocomial outbreaks due to Salmonella Livingstone in a pediatric ward in Sfax hospital using molecular typing techniques.

Materials and methods. - We included 84 strains of S. Livingstone isolated from patients hospitalized in a pediatric ward between November 1999 through August 2002 in addition to one environmental sample. Three epidemiological unrelated strains of S. Livingstone were also tested. The molecular typing techniques were: plasmid analysis, enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR), random amplification of polymorphic DNA (RAPD-PCR) and pulsed field gel electrophoresis (PFGE).

Results. - The plasmid analysis and the ERIC-PCR generated a similar profile for outbreak isolates including the environmental sample while the epidemiologically unrelated strains demonstrated distinct patterns. The RAPD-PCR applied on 20 strains showed three patterns but one profile was predominating. All the strains isolate of S. Livingstone, except the veterinary strain, could not be typed by PFGE.

Conclusion. -> Using the molecular typing techniques, we showed that these two outbreaks in the pediatric ward were due to the clonal spread of a single strain of S. Livingstone. The identification of the source of contamination and the improvement of hygiene conditions are required.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Épidémie, Infection nosocomiale, Salmonella Livingstone, Marqueur épidémiologique, Service de pédiatrie

Keywords : Outbreak, Nosocomial infection, Salmonella Livingstone, Molecular typing, Pediatric ward


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Vol 54 - N° 6

P. 331-336 - juillet 2006 Retour au numéro
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