S'abonner

Identification of outer membrane proteins of Mycobacterium tuberculosis - 23/08/11

Doi : 10.1016/j.tube.2008.02.004 
Houhui Song a, d, Reatha Sandie b, d, Ying Wang a, d, Miguel A. Andrade-Navarro b, c, Michael Niederweis a,
a Department of Microbiology, University of Alabama at Birmingham, 609 Bevill Biomedical Research Building, 845 19th Street South, Birmingham, AL 35294, USA 
b Bioinformatics Group, Ottawa Health Research Institute, 501 Smyth Road, Ottawa, Ontario, K1H 8L6, Canada 
c Max Delbrück Center for Molecular Medicine, Robert-Rössle-Str. 10, 13125 Berlin, Germany 

Corresponding author. Tel.: +1 205 996 2711; fax: +1 205 934 9256.

Summary

The cell wall of mycobacteria includes an unusual outer membrane of extremely low permeability. While Escherichia coli uses more than 60 proteins to functionalize its outer membrane, only two mycobacterial outer membrane proteins (OMPs) are known. The porin MspA of Mycobacterium smegmatis provided the proof of principle that integral mycobacterial OMPs share the β-barrel structure, the absence of hydrophobic ⍺-helices and the presence of a signal peptide with OMPs of gram-negative bacteria. These properties were exploited in a multi-step bioinformatic approach to predict OMPs of M. tuberculosis. A secondary structure analysis was performed for 587 proteins of M. tuberculosis predicted to be exported. Scores were calculated for the β-strand content and the amphiphilicity of the β-strands. Reference OMPs of gram-negative bacteria defined threshold values for these parameters that were met by 144 proteins of unknown function of M. tuberculosis. Two of them were verified as OMPs by a novel two-step experimental approach. Rv1698 and Rv1973 were detected only in the total membrane fraction of M. bovis BCG in Western blot experiments, while proteinase K digestion of whole cells showed the surface accessibility of these proteins. These findings established that Rv1698 and Rv1973 are indeed localized in the outer membrane and tripled the number of known OMPs of M. tuberculosis. Significantly, these results provide evidence for the usefulness of the bioinformatic approach to predict mycobacterial OMPs and indicate that M. tuberculosis likely has many OMPs with β-barrel structure. Our findings pave the way to identify the set of proteins which functionalize the outer membrane of M. tuberculosis.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

keywords : Secondary structure, Prediction, Amphiphilicity, Beta-strand, Exported, Inner membrane, Periplasmic, Secreted proteins

Abbreviations : OM, OMP, IM, IMP, wt


Plan


© 2008  Elsevier Ltd. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 88 - N° 6

P. 526-544 - novembre 2008 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Identification of genes of Mycobacterium tuberculosis upregulated during anaerobic persistence by fluorescence and kanamycin resistance selection
  • Alka Saxena, Vikas Srivastava, Ranjana Srivastava, Brahm S. Srivastava
| Article suivant Article suivant
  • IS6110 in oriC affects the morphology and growth of Mycobacterium tuberculosis and attenuates virulence in mice
  • Yveth Casart, Lilia Turcios, Ingrid Florez, Rossana Jaspe, Elba Guerrero, Jacobus de Waard, Diana Aguilar, Rogelio Hérnandez-Pando, Leiria Salazar

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

Déjà abonné à cette revue ?

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2024 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.