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Analysis of the fusA2 locus encoding EFG2 in Mycobacterium smegmatis - 22/08/11

Doi : 10.1016/j.tube.2009.06.003 
Anuradha Seshadri, Laasya Samhita, Rahul Gaur, Vidyasagar Malshetty, Umesh Varshney
Department of Microbiology and Cell Biology, Indian Institute of Science, CNR Rao Circle, Bangalore 560012, India 

Corresponding author. Tel.: +91 80 2293 2686; fax: +91 80 2360 2697.

Summary

The translation elongation factor G (EFG) is encoded by the fusA gene. Several bacteria possess a second fusA-like locus, fusA2 which encodes EFG2. A comparison of EFG and EFG2 from various bacteria reveals that EFG2 preserves domain organization and maintains significant sequence homology with EFG, suggesting that EFG2 may function as an elongation factor. However, with the single exception of a recent study on Thermus thermophilus EFG2, this class of EFG-like factors has not been investigated. Here, we have characterized EFG2 (MSMEG_6535) from Mycobacterium smegmatis. Expression of EFG2 was detected in stationary phase cultures of M. smegmatis (Msm). Our in vitro studies show that while MsmEFG2 binds guanine nucleotides, it lacks the ribosome-dependent GTPase activity characteristic of EFGs. Furthermore, unlike MsmEFG (MSMEG_1400), MsmEFG2 failed to rescue an E. coli strain harboring a temperature-sensitive allele of EFG, for its growth at the non-permissive temperature. Subsequent experiments showed that the fusA2 gene could be disrupted in M. smegmatis mc2155 with KanR marker. The M. smegmatis fusA2::kan strain was viable and showed growth kinetics similar to that of the parent strain (wild-type for fusA2). However, in the growth competition assays, the disruption of fusA2 was found to confer a fitness disadvantage to M. smegmatis, raising the possibility that EFG2 is of some physiological relevance to mycobacteria.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : EFG2, GTPase, Mycobacterium smegmatis, Competitive fitness


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Vol 89 - N° 6

P. 453-464 - novembre 2009 Retour au numéro
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  • Tuberculosis ethambutol resistance: Concordance between phenotypic and genotypic test results
  • Claudia Plinke, Helen S. Cox, Stobdan Kalon, Daribay Doshetov, Sabine Rüsch-Gerdes, Stefan Niemann

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