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The MycoBrowser portal: A comprehensive and manually annotated resource for mycobacterial genomes - 20/08/11

Doi : 10.1016/j.tube.2010.09.006 
Adamandia Kapopoulou , Jocelyne M. Lew , Stewart T. Cole
Global Health Institute, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Station 19, CH-1015 Lausanne, Switzerland 

Corresponding author. Tel.: +41 21 69 31851; fax: +41 21 69 31790.

Summary

In this paper, we present the MycoBrowser portal (mycobrowser.epfl.ch/), a resource that provides both in silico generated and manually reviewed information within databases dedicated to the complete genomes of Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium leprae, Mycobacterium marinum and Mycobacterium smegmatis. A central component of MycoBrowser is TubercuList (tuberculist.epfl.ch), which has recently benefited from a new data management system and web interface. These improvements were extended to all MycoBrowser databases. We provide an overview of the functionalities available and the different ways of interrogating the data then discuss how both the new information and the latest features are helping the mycobacterial research communities.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Tuberculosis, Leprosy, Genome sequence, Genome annotation, Database


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Vol 91 - N° 1

P. 8-13 - janvier 2011 Retour au numéro
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  • TubercuList – 10 years after
  • Jocelyne M. Lew, Adamandia Kapopoulou, Louis M. Jones, Stewart T. Cole
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  • Genotyping did not evidence any contribution of Mycobacterium bovis to human tuberculosis in Brazil
  • Adalgiza Rocha, Atina R. Elias, Luciana F. Sobral, Diego F. Soares, Alexandre C. Santos, Ana-Grazia Marsico, Mariana A. Hacker, Paulo C. Caldas, Luiz C. Parente, Marcio R. Silva, Leila Fonseca, Philip Suffys, Neio Boéchat

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