Routine bacteriological techniques do not allow detection of the most frequent enteric pathogens in young children: enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) and shigatoxinogenic E. coli (STEC/EHEC). Since there is no correlation between serotype and pathotype, a genotypic determination is therefore necessary for the identification of these pathogenic strains. We evaluated the Genotype® EHEC test (Hain Life Science, Germany), a new rapid system based on DNA multiplex amplification and further hybridization for the detection of shigatoxin stx1, stx2 genes, intimin eae gene and invasin ipaH gene harbored by Shigella and enteroinvasive E. coli (EIEC). E. coli strains of various serogroups isolated from children with acute gastroenteritis, hemorrhagic colitis or hemolytic-uremic syndrome were tested. Their genotypes were first determined by standard in-house PCR. The strains collection included 11 STEC/EHEC (serogroups O157, O111, O26, O91, O-untypable) and nine EPEC (serogroups O26, O157, O55, O126, O127, O-untypable). The same strains were tested with Genotype® EHEC. For all the strains, the hybridization banding pattern obtained by Genotype® EHEC correlated with their expected genotypic characteristics. No specific equipment is required, except a thermocycler. Absence of electrophoresis system, of ethidium bromide staining and imaging system is a clear-cut advantage of Genotype® EHEC. In addition, the short testing time (less than 2 h) optimizes treatment orientation. The Genotype® EHEC test allows an easy and reliable identification of EHEC, STEC, EPEC and also EIEC. As such, it is a useful tool for the rapid diagnosis of diarrheal diseases.

Les techniques de routine utilisées dans les laboratoires de bactériologie médicale ne permettent pas de détecter les E. coli pathogènes des diarrhées infantiles, notamment les E. coli enteropathogènes (EPEC) et shigatoxinogènes ou enterohémorragiques (STEC/EHEC). En raison de l'absence de corrélation entre sérotype et pathotype, il est nécessaire d'utiliser une technique génétique d'identification. Nous avons évalué le test Genotype® EHEC (Hain Life Science, Germany), un nouveau système fondé sur l'amplification génique suivie d'une hybridation permettant de détecter les gènes stx1 et stx2 des shigatoxines, le gène eae de l'intime et le gène ipaH trouvé chez les E. coli enteroinvasif (EIEC) et les Shigella. Des souches d'E. coli de différents sérogroupes isolés chez des enfants présentant une gastro-entérite aiguë, une colite hémorragique ou un syndrome hémolytique urémique ont été testées avec le test Genotype® EHEC (Hain Life Science, Germany). La collection de souches comprenait onze STEC/EHEC (de sérogroupe O26, O157, O111, O91, O-nontypé) et neuf EPEC (de sérogroupe O26, O157, O55, O126, O127, O-nontypé) ; leur génotype avait été préalablement déterminé par PCR « maison » standard. Pour toutes les souches le profil de virulence obtenu avec le test Genotype® EHEC correspondait à celui attendu. Le test Genotype® EHEC ne requiert aucun équipement spécial et présente les avantages d'une révélation sans système électrophorétique, sans coloration au bromure d'éthidium et sans système d'imagerie. De plus, le délai de réponse très court, inférieur à deux heures, rend le test précieux pour un diagnostic rapide des infections intestinales et optimise l'orientation thérapeutique.