Les troubles fonctionnels intestinaux (TFI) correspondent à des symptômes digestifs chroniques qui orientent vers un dysfonctionnement de la partie basse du tube digestif et qui ne s'expliquent par aucune anomalie organique. Le principal TFI est le syndrome de l'intestin irritable (SII) au cours duquel la symptomatologie est dominée par une douleur ou un inconfort chronique de l'abdomen associé(e) à des troubles du transit, diarrhée, constipation ou alternance des deux. La physiopathologie du SII, multifactorielle, est dominée par un dysfonctionnement des communications nerveuses bidirectionnelles qui existent entre le système nerveux entérique et le système nerveux central, et au sein desquelles la sérotonine est un médiateur très important. Ce dysfonctionnement est à l'origine d'une hypersensibilité viscérale qui est le phénomène majeur à l'origine de la douleur abdominale. L'accent est également mis actuellement sur le rôle d'une micro-inflammation et de perturbations du fonctionnement de certaines cellules immunocompétentes, notamment les mastocytes, au contact des terminaisons sensitives digestives. Dans certains cas, cette micro-inflammation paraît la séquelle d'une infection intestinale aiguë initiale. Ces progrès dans la compréhension de la physiopathologie du SII expliquent l'évolution de la stratégie thérapeutique qui ne se limite plus à l'emploi d'antispasmodiques et de médicaments régulateurs du transit intestinal. Le recours à des drogues agissant sur la sensibilité viscérale est actuellement privilégié. Dans ce cadre, à côté des antidépresseurs tricycliques à doses faibles, l'emploi de médicaments agissant sur les récepteurs de la sérotonine (antagonistes des récepteurs de type 3, agonistes partiels des récepteurs de type 4) est une approche nouvelle. Le rôle joué par les émotions ou les évènements de vie, le comportement face à la maladie, dans l'apparition puis l'évolution des symptômes ainsi que dans l'intégration centrale des messages sensitifs d'origine viscérale, rendent logique d'envisager une approche non médicamenteuse (psychothérapie, relaxation, hypnose), notamment chez les malades les plus sévères qui demeurent encore fréquemment des échecs symptomatiques du seul traitement médicamenteux.