Évolution des souches de Rotavirus du groupe A en circulation en Tunisie sur une période de trois ans (2005–2007) - 10/08/11
Evolution of group A Rotavirus strains circulating in Tunisia over a 3-year period (2005–2007)
, A.D. Steele m
Auteur correspondant.Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.
| pages | 1 |
| Iconographies | 3 |
| Vidéos | 0 |
| Autres | 0 |
Résumé |
But de l’étude |
Le suivi épidémiologique des infections à Rotavirus repose sur l’analyse moléculaire des souches circulantes. La diversité génomique des rotavirus du groupe A peut être analysée par électrophorèse sur gel de polyacrylamide (PAGE) des 11 fragments d’ARN double brin génomiques, ou mieux par détermination des spécificités géniques VP7 et VP4, permettant ainsi une classification en génotypes G et P, respectivement. Le principal objectif du présent travail était de suivre l’évolution des souches de RV du groupe A en circulation en Tunisie sur une période de trois ans, de 2005 à 2007.
Matériel et méthodes |
L’enquête a porté sur 1503 échantillons de selles provenant d’enfants de moins de cinq ans consultant ou hospitalisés en Tunisie pour diarrhée entre 2005 et 2007. Les prélèvements positifs en Rotavirus ont été analysés par PAGE puis génotypés par deux types de RT-PCR semi-nichées multiplex.
Résultats |
Le RV a été retrouvé dans 323 échantillons de selles parmi 1503 (21 %). Les électrophorétypes longs ont prédominé en Tunisie tout au long de la période d’étude (n=158 versus n=82 électrophorétypes courts). Le génotypage VP7 a permis la mise en évidence de cinq génotypes différents : G1, G2, G3, G4 et G9. Les résultats du typage VP4 ont montré une cocirculation des génotypes P[8], P[4], P[6] et P[11]. L’association G3P[8] était prédominante en Tunisie en 2005 et 2006, cédant la place aux souches G2P[4] en 2007.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Abstract |
Background |
Rotaviruses are the most frequent agents associated with diarrhoea in children worldwide. Analysis of mobility of the 11 segments of genomic RNA by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) yields a pattern which is characteristic for a particular rotavirus isolate. The group A rotaviruses can be further characterized by analysis of VP7 and VP4 genes specificities, responsible for rotavirus classification into G and P genotypes, respectively. The aim of the present study was to determine the evolution of group A Rotavirus strains circulating in Tunisia over a 3-year period (2005–2007).
Material and methods |
A total of 1503 stool samples collected from children less than five years old, consulting or hospitalised in Tunisia for diarrhoea between 2005 and 2007, were screened for the presence of group A Rotaviruses. Rotavirus-positive specimens were further analyzed by PAGE and G/P-genotyped by multiplex semi-nested RT-PCR.
Results |
Rotaviruses were detected in 323 stool samples over 1503 (21 %). Long electropherotypes predominated in Tunisia during the whole period of study (N=158 vs N=82 short electropherotypes). VP7 genotyping showed the cocirculation of five different genotypes: G1, G2, G3, G4 and G9. VP4 typing detected four different P-genotypes: P[8], P[4], P[6] and P[11]. Rotavirus strains with G3P[8] specificity were predominating in Tunisia in 2005 and 2006, replaced by G2P[4] strains in 2007.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : Rotavirus, Gastroentérite, Électrophorétype, Génotypage, VP7, VP4
Keywords : Rotavirus, Gastroenteritis, Electropherotype, Genotyping, VP7, VP4
Plan
Vol 59 - N° 4
P. e79-e83 - août 2011 Retour au numéro
Article précédent
- Détection du virus de l’hépatite A dans les coquillages en Tunisie par reverse transcription-nested PCR – recherche de corrélation entre la contamination virale et bactérienne
- I. Amri, F. Hmaïed, F. Loisy, B. Lebeau, I. Barkallah, M. Saidi, A. Slim
- Infection par le virus de la chorioméningite lymphocytaire et fœtopathies
- N. Hannachi, F. Freymuth, D. Luton, M. Herlicoviez, J.-F. Oury, J. Boukadida, P. Lebon
Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.
Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’achat d’article à l’unité est indisponible à l’heure actuelle.
Déjà abonné à cette revue ?