Détection du virus de l’hépatite A dans les coquillages en Tunisie par reverse transcription-nested PCR – recherche de corrélation entre la contamination virale et bactérienne - 10/08/11
, F. Loisy b, B. Lebeau b, I. Barkallah a, M. Saidi a, A. Slim c
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Résumé |
Buts de l’étude |
Nous nous proposons dans cette étude d’évaluer la contamination par le virus de l’hépatite A (VHA) de coquillages collectés à partir de cinq zones conchylicoles tunisiennes et de rechercher une éventuelle corrélation entre la contamination bactérienne et virale.
Matériel et méthodes |
Cinquante-quatre échantillons de coquillages ont fait l’objet d’une extraction virale par 2 méthodes l’une utilisant l’élution par une solution de glycine et l’autre utilisant une solution d’extrait de bœuf. Les deux méthodes ont été comparées par l’application d’une reverse transcription suivie d’une nested PCR. La recherche de Salmonella et d’E. coli a été réalisée dans tous les échantillons de coquillages inclus dans cette étude.
Résultats |
Sur les deux techniques testées, la technique à base de glycine a affiché le rendement le plus élevé. Le virus de l’hépatite A a été détecté dans 32 % des échantillons de coquillages analysés. Les résultats des analyses bactériologiques ont montré une absence de Salmonella et une contamination par E. coli. Parmi les 17 échantillons de coquillages contaminés par le VHA, six échantillons se sont révélés ayant une contamination par E. coli<à la limite de législation.
Conclusion |
Nous avons constaté une contamination assez élevée des échantillons de coquillages collectés. Une absence de corrélation entre la contamination bactérienne et virale a été notée.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Abstract |
Objectives |
We aimed at evaluating the contamination by hepatitis A virus (HAV) of 54 shellfish samples collected from five Tunisian shellfish harvesting areas and finding a correlation between bacterial and viral contamination.
Material and methods |
Fifty-four shellfish samples were analysed in our study. Two methods of viral extraction were evaluated by reverse transcription-nested PCR. The first one was based on elution by glycine solution and the second one used a beef extract solution. Bacteriological determination (Samonella and E. coli) was carried out for all shellfish samples.
Results |
Glycine extraction showed a higher detection rate of HAV compared to the saline beef extraction method. The hepatitis A virus was detected in 32 % of shellfish samples analysed. None of the samples revealed the presence of Samonella. From 17 samples positive for HAV, we found six samples showing a number of E. coli below the European legislation.
Conclusion |
An important HAV contamination was observed in our study. No correlation between bacterial and viral contamination was found.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : VHA, Coquillages, Extraction, Contamination, RT-Nested-PCR, E. coli
Keywords : HAV, Shellfish, Extraction, Contamination, RT-Nested-PCR, E. coli
Plan
Vol 59 - N° 4
P. 217-221 - août 2011 Retour au numéro
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