Antimicrobial resistance and molecular analysis of non-typhoidal Salmonella isolates from human in Tunisia - 10/08/11
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Abstract |
During the period from 2006 to 2007, a total of 32 clinical isolates of Salmonella enterica were isolated from diarrheagenic stool samples and further examined for their susceptibility to various antibiotics. Sixteen of the human isolates were from the capital Tunis, 11 were from Sousse, four were from Nabeul and one was from Mahdia, Tunisia. The isolates were serotyped and identified at the National Centre of Enteropathogenic Bacteria, Pasteur Institute, Tunis (Centre National de Salmonella, Shigella et Vibrio – Institut pasteur de Tunis); nine distinct serovars were identified: Enteritidis (n=20), Typhimurium (n=4), Zanzibar (n=2), Manhattan (n=1), Bovismorbificans (n=1), Amsterdam (n=1), Saint Paul (n=1), Kentucky (n=1) and Muenster (n=1). Our results showed that 25 Salmonella isolates (78.1 %) were resistant to antibiotics with 20 isolates (62.5 %) displayed resistance to ampicillin. Isolates sharing invA gene, as shown by PCR amplification, were further characterized by the techniques of pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) using the restriction enzyme XbaI and plasmid analysis to determine possible genetic relationships among Salmonella enterica clinical isolates and to assess genetic diversity. Plasmid profiling identified seven plasmid profiles (with 1–5 plasmids) among the isolates; four isolates (Salmonella Kentucky, Salmonella Muenster, Salmonella Bovismorbificans and Salmonella Zanzibar) did not carry any plasmid. The isolates were differentiated into 10 distinct XbaI-pulsotypes. Our findings show genetic diversity among the different serovars and cluster analysis of compiled serotyping, PFGE, plasmid profiling and antibiotic resistance data provided additional discrimination.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Résumé |
Pendant la période de 2006 à 2007, 32 souches cliniques de Salmonella enterica ont été isolées à partir d’échantillons de selles diarrhéiques et ont été ensuite examinées pour leur susceptibilité vis-à-vis de divers antibiotiques. Seize souches ont été isolées dans la capitale Tunis, 11 dans la ville de Sousse, quatre dans la ville de Nabeul et une souche dans la ville de Mahdia, Tunisie. Les souches ont été syrotypées et identifiées par le Centre national de Salmonella, Shigella et Vibrio – institut pasteur de Tunis (National Centre of Enteropathogenic Bacteria, Pasteur Institute, Tunis) ; neuf sérovars ont été identifiés : Enteritidis (n=20), Typhimurium (n=4), Zanzibar (n=2), Manhattan (n= 1), Bovismorbificans (n=1), Amsterdam (n=1), Saint Paul (n=1), Kentucky (n=1) et Muenster (n=1). Nos résultats montrent que 25 souches de salmonelles (78,1 %) sont résistantes aux antibiotiques avec 20 souches (62,5 %) montrant une résistance à l’ampicilline. Après amplification par PCR, toutes les souches partageant le gène invA ont fait l’objet d’une caractérisation par électrophorèse en champ pulsé (ECP) en utilisant l’enzyme de restriction XbaI et par analyse plasmidique dans le but d’évaluer la diversité génétique et de déterminer des relations génétiques possibles entre les différentes souches de Salmonella enterica. L’analyse plasmidique a montré sept profils plasmidiques (avec un à cinq plasmides) parmi les souches isolées ; quatre souches (Salmonella Kentucky, Salmonella Muenster, Salmonella Bovismorbificans et Salmonella Zanzibar) n’ont montré aucun plasmide. Les souches isolées ont été différenciées en dix différents pulsotypes. Nos résultats montrent une diversité génétique parmi les différents sérovars et le regroupement par combinaison du sérotypage, ECP, profils plasmidiques et résistance aux antibiotiques a fourni une discrimination supplémentaire.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Keywords : Salmonella, Clinical, Serotyping, Pulsed-field gel electrophoresis, InvA gene, Antimicrobial resistance, Plasmid profile
Mots clés : Salmonelles, Cliniques, Sérotypage, Électrophorèse en champ pulsé, Gène invA, Résistance aux antibiotiques, Profil plasmidique
Plan
Vol 59 - N° 4
P. 207-212 - août 2011 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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