Species that belong to the Nocardia genus are filamentous strict aerobic Gram-positive bacteria. The traditional identification system of these species is based on the phenotypic, biochemical and chemotaxonomic characteristics. However, new methods based on the study of 16S ribosomal RNA have allowed a remarkable increase in the detection of new species. This is considered an important identification tool, it is also a less time consuming process. This study shows 53 strains of clinical origin, the DNA was extracted and amplified from pure colonies growing on Bennett’s agar. A PCR was conducted using primers Noc1 and Noc2 (Rodriguez-Nava et al., 2006) [23Rodriguez-Nava V., Devulder A., Couble A., Boiron P., Laurent F. Use of PCR-restriction enzyme pattern analysis and sequencing database for hsp65 gene-based identification of Nocardia species J Clin Microbiol 2006 ;  44 : 536-546 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références], which enabled us to amplify a specific region of 16S rRNA, followed by sequencing each of the PCR products. This approach allowed us to identify molecular species frequently reported as etiological agents of actinomycetoma and nocardiosis, such as N. brasiliensis, N. otitidiscaviarum, N. farcinica, and N. nova, as well as other species that have been described recently as N. cerradoensis, N. mexicana, N. cyriacigeorgica, and N. veterana, which so far have not been reported in clinical cases in Venezuela.

Les espèces du genre Nocardia sont des bactéries filamenteuses, aérobies strictes et à coloration de Gram positive. Le système d’identification traditionnel de ces espèces est basé sur l’étude des caractéristiques biochimiques et chimiotaxonomiques. Toutefois, les nouvelles méthodes basées sur l’étude de l’ARN ribosomal 16S ont conduit à une augmentation considérable du nombre de nouvelles espèces identifiées. Elles constituent donc un outil d’identification important, nécessitant un temps plus court de mise en œuvre. La présente étude porte sur 53 souches d’origine clinique. L’ADN a été extrait et amplifié à partir de colonies pures sur milieu de Bennett. Une PCR a été utilisée avec les amorces Noc1 et Noc2 (Rodriguez-Nava et al., 2006) [23Rodriguez-Nava V., Devulder A., Couble A., Boiron P., Laurent F. Use of PCR-restriction enzyme pattern analysis and sequencing database for hsp65 gene-based identification of Nocardia species J Clin Microbiol 2006 ;  44 : 536-546 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références] capable d’amplifier une région spécifique de l’ARNr 16S et le séquençage de chacun des produits amplifiés a été réalisé. Cette étude a conduit à identifier des espèces fréquemment rapportées comme agents étiologiques de mycétome et de nocardiose, comme N. brasiliensis, N. otitidiscaviarum, N. farcinica et N. nova, et d’autres espèces récemment décrites comme N. cerradoensis, N. mexicana, N. cyriacigeorgica et N. veterana, qui n’avaient jamais été rapportées dans des cas cliniques au Venezuela avec des conséquences directes sur l’épidémiologie clinique des infections à Nocardia dans ce pays.