Le portage digestif asymptomatique d’entérocoques résistants aux glycopeptides (ERG) est une préoccupation d’hygiène hospitalière.

Nous comparons les résultats de deux protocoles de dépistage des ERG au laboratoire et évaluons un kit associant amplification multiplex et hybridation (Génotype^® Enterococcus, Hain Lifescience) sur un panel prospectif de 448 échantillons (écouvillonnage rectal ou selles) colligés durant quatre mois.

Le protocole « direct » comprend l’ensemencement de l’échantillon sur gélose sélective, l’identification par galerie conventionnelle et l’antibiogramme par diffusion en gélose ; le second protocole ajoute une phase d’enrichissement préalable et un diagnostic moléculaire permettant l’identification d’espèce et la détermination du génotype de résistance aux glycopeptides. La technique de référence est l’amplification du gène codant pour l’ARN 16S couplée au séquençage.

Le protocole « direct » n’a mis en évidence aucune souche de concentration minimale inhibitrice (CMI) supérieure à 4mg/l de la vancomycine. Le protocole « enrichissement » permet l’isolement de deux souches d’Enterococcus faecium VanA à haut niveau de résistance aux glycopeptides. Six Enterococcus gallinarum VanC1 et deux Enterococcus casseliflavus VanC2/C3 sont également isolés. L’incidence du portage des ERG (VanA) est de 0,55 % (deux patients sur 362, deux isolats sur 448). Les services cliniques concernés sont des consommateurs de glycopeptides. Les deux patients porteurs d’isolats d’E. faecium VanA ont reçu des glycopeptides pendant dix jours dans le mois précédent. Dans trois cas, la méthode moléculaire permet de corriger des résultats erronés obtenus par identification rapide (galerie RapidID32Strep V2.0, bioMérieux).

La méthode directe sous estime le portage d’ERG. La technique moléculaire Génotype^® Enterococcus s’avère performante et riche en informations à caractère épidémiologique. Son coût et son excellente praticabilité lui confèrent un rôle d’expertise en cas de découverte d’un portage d’ERG à haut niveau de résistance ou d’une infection à ERG dans un service à risque.

The monitoring of infection by glycopeptide-resistant enterococci (GRE) is one of the main elements of hospital hygiene policy. It involves systematic rectal swabs in clinics at risk (asymptomatic carriage).

We compare two GRE screening methods and evaluate a new kit associating multiplex PCR and hybridization (Génotype^® Enterococcus, Hain Lifescience) on a panel of 448 samples collected over a 4-month period.

The first method is based on direct inoculation of the sample; the second one involves a preliminary enrichment phase followed by molecular diagnosis allowing the identification of species of enterococci as well as glycopeptide resistance genes.

All the resistant strains were isolated using the enrichment technique. The incidence of GRE (VanA) carriage was 0,55% (two out of 362 patients, two out of 448 isolates) with two Enterococcus faecium VanA. Six Enterococcus gallinarum VanC1 and two Enterococcus casseliflavus VanC2/C3 were also isolated and identified. The main clinics concerned are intensive care and hematology. The two patients with E. faecium VanA had been previously given glycopeptides for 10 days. For three strains, the molecular method allowed to correct prior erroneous results based on rapid identification (RapidID32Strep V2.0).

The method using direct samples inoculation underestimates real incidence of GRE carriage. The performances of Génotype^® Enterococcus molecular method, evaluated for other parameters using reference strains and DNA sequencing, offer new possibilities applicable to routine laboratory.