Évaluer la PCR temps réel Cepheid Xpert SAMR/SA sur GeneXpert^® DX System par rapport aux techniques usuelles et son impact clinique sur l’attitude thérapeutique.

Sur une période de 18mois (de février 2008 à juillet 2009) au centre hospitalier d’Argenteuil, 51 PCR temps réel Cepheid Xpert SAMR/SA sur GeneXpert^® DX System ont été réalisées sur des flacons d’hémocultures présentant un examen direct positif à staphylocoque. Le résultat de la PCR était transmis au clinicien par la microbiologie ; si une antibiothérapie probabiliste avait été prescrite, elle était modifiée si nécessaire après discussion entre le clinicien et le référent antibiothérapie.

Vingt-trois PCR étaient positives pour Staphylococcus aureus dont deux souches résistantes à la méticilline, 28 étaient des staphylocoques à coagulase négative. Aucune discordance entre l’identification (S. aureus) et la résistance à la méticilline n’a été observée. Parmi les 32 bactériémies cliniquement significatives (23 à S. aureus et neuf à staphylocoque à coagulase négative) : 16 patients (50 %) avaient une antibiothérapie inadaptée (11 patients sans antibiothérapie, cinq sous bêtalactamines). Pour ces 16 patients, une antibiothérapie adaptée a été mise en place après transmission du résultat de la PCR au clinicien. Seize patients avaient une antibiothérapie probabiliste adaptée au moment de la transmission du résultat. Parmi ces 16 patients, huit ont eu un changement d’antibiothérapie d’un large spectre à un spectre uniquement antistaphylococcique. Parmi les 19 hémocultures positives à staphylocoque à coagulase négative non cliniquement significatives : quatre patients avaient une antibiothérapie pour d’autres infections et leur traitement n’a pas été modifié, les 15 autres n’ont pas eu d’antibiothérapie. Treize antibiothérapies probabilistes ont été évitées chez des patients ayant un contexte clinique compatible avec une bactériémie à staphylocoque (plaies cutanées, antécédent de portage ou d’infection à S. aureus sensible ou résistant à la méticilline, présence de matériel intravasculaire ou de prothèse).

La PCR temps réel Cepheid Xpert SAMR/SA sur GeneXpert^® DX System est devenu un outil incontournable au sein de notre laboratoire dans l’accompagnement du rendu d’une hémoculture positive à staphylocoque. Ce test est rapide (50minutes) et fiable et permet d’optimiser l’antibiothérapie au sein d’un hôpital.

Recently, a rapid, fully automated real-time PCR test has become available for detection of Staphylococcus aureus in positive blood cultures, Xpert MRSA/SA blood culture. This study was defined to evaluate the use of this product in our hospital setting to assist in optimizing antibiotic treatment.

Over a period of 18months (from February 2008 to July 2009), 51 positive blood cultures were examined for Staphylococcus using the Xpert MRSA/SA assay on the GeneXpert^® System. The PCR results were transferred to the clinician as soon as available. The presence of empirical antibiotic therapy was noted and modified if necessary after discussions between the clinician and the infectious disease specialist.

Twenty-three blood bottles were positive for S. aureus, two were resistant to methicillin. Twenty-eight were coagulase negative staphylococci. No discrepancy between identification (S. aureus) and methicillin resistance was observed. Thirty-two samples had clinically significant bacteremia (23 S. aureus and nine coagulase negative staphylococci). Sixteen (50%) of these patients had received inappropriate antibiotic therapy (11 without antibiotic therapy, five with betalactam antibiotics). For these patients, an appropriate antibiotic therapy was prescribed according to these results. Sixteen patients had adequate empirical antibiotic therapy at the time of receiving the PCR result. Among these 16 patients, eight switches were performed from broad-spectrum treatment to a more restrictive antistaphylococcal treatment. Of the 19 patients with a nonclinically relevant coagulase negative staphylococci infection, four were already on antibiotics for other infections and these treatments were not modified. Empirical treatment could be avoided in 13 patients who had a clinical presentation consistent with staphylococcal bacteremia (multiple sores, history of carrying methicllin-resistant or susceptible S. aureus infection, presence of intravascular material or prosthesis).

The real-time PCR Cepheid Xpert MRSA/SA on GeneXpert^® DX System has become an essential tool in our laboratory enhancing the reports of positive blood cultures for staphylococci. This test is fast (50min) and reliable. It allows optimization of antibiotic therapy in hospital.