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A transcriptome-based examination of blood group expression - 18/08/10

Doi : 10.1016/j.tracli.2010.06.010 
S.-J. Noh, Y.T. Lee, C. Byrnes, J.L. Miller
Molecular Medicine Branch, National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (NIDDK), National Institutes of Health (NIH), 31 Center Drive, Bethesda, Building 10, Room 9N311, MD 20892, USA 

Corresponding author.

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Abstract

Over the last two decades, red cell biologists witnessed a vast expansion of genetic-based information pertaining to blood group antigens and their carrier molecules. Genetic progress has led to a better comprehension of the associated antigens. To assist with studies concerning the integrated regulation and function of blood groups, transcript levels for each of the 36 associated genes were studied. Profiles using mRNA from directly sampled reticulocytes and cultured primary erythroblasts are summarized in this report. Transcriptome profiles suggest a highly regulated pattern of blood group gene expression during erythroid differentiation and ontogeny. Approximately one-third of the blood group carrier genes are transcribed in an erythroid-specific fashion. Low-level and indistinct expression was noted for most of the carbohydrate-associated genes. Methods are now being developed to further explore and manipulate expression of the blood group genes at all stages of human erythropoiesis.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Au cours des deux dernières décennies, un grand nombre d’informations se sont accumulées sur la génétique des antigènes de groupes sanguins et des molécules les portant. Dans le cadre des études visant à obtenir une vision intégrée de la régulation et de la fonction des antigènes de groupes sanguins, le taux des transcrits de 36 gènes associés ont été analysés. Les résultats obtenus à partir de réticulocytes directement issus de sang total et d’érythroblastes obtenus à partir de cultures primaires sont présentés dans cette revue. L’analyse des résultats suggère que l’expression des gènes de groupes sanguins est hautement régulée au cours de la différenciation érythroïde et de l’ontogenèse. Environ un tiers des gènes codant pour des groupes sanguins sont transcrits de manière spécifiquement érythroïde. Un niveau faible et ubiquitaire d’expression a été observé pour les gènes associés à la synthèse de carbohydrates. Des méthodes sont actuellement développées pour analyser plus avant et manipuler l’expression des gènes de groupes sanguins à tous les stades de l’érythropoïèse humaine.

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Keywords : Transcriptome, Blood group, Erythropoiesis, RNA

Mots clés : Érythropoïèse, Transcriptome, Groupes sanguins, ARN


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Vol 17 - N° 3

P. 120-125 - septembre 2010 Retour au numéro
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  • Diamond-Blackfan anemia, ribosome and erythropoiesis
  • L. Da Costa, H. Moniz, M. Simansour, G. Tchernia, N. Mohandas, T. Leblanc
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  • Rac GTPases in erythroid biology
  • D.G. Konstantinidis, A. George, T.A. Kalfa

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