Évaluation de la plate-forme de PCR en temps réel LightCycler® 480 pour la mesure des charges virales CMV, EBV, HHV-6 et BKV dans le sang total - 20/04/10
, C. Deback a, b, J. Géli a, b, Z. Aït-Arkoub b, F. Angleraud b, A. Gautheret-Dejean a, b, c, H. Agut a, b
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Résumé |
Objectif |
La plate-forme de PCR en temps réel LightCycler® 480 (LC480) a été évaluée pour le diagnostic moléculaire quantitatif des infections virales opportunistes dues au cytomégalovirus humain (CMV), au virus Epstein-Barr (EBV), au sixième herpèsvirus humain (HHV-6) et au virus BK (BKV), en comparaison avec des techniques de PCR en temps réel de référence (techniques « maison »).
Patients et méthodes |
Un total de 253 prélèvements de sang total provenant de patients greffés a été testé.
Résultats |
Les méthodes de référence et LC480 étaient très bien corrélées (coefficient de corrélation de Spearman Rho≥0,85 ; p<0,0001) avec une excellente concordance d’un point de vue qualitatif (90,5 %) et sans différence significative d’un point de vue quantitatif pour l’ensemble des quatre virus testés. L’exactitude des protocoles sur le LC480 a été confirmée par les résultats obtenus avec les 44 échantillons du contrôle de qualité pour le diagnostic moléculaire 2008 (Quality Control for Molecular Diagnosis [QCMD]).
Conclusion |
Le système LC480 est un automate de PCR en temps réel parfaitement adapté à l’activité hospitalière d’un laboratoire de virologie pour le diagnostic et le suivi des infections virales opportunistes chez les patients greffés par la mesure des charges virales CMV, EBV, HHV-6 et BKV dans les prélèvements de sang total.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Abstract |
Objective |
The Roche LightCycler® 480 (LC480) system was evaluated for quantitative molecular diagnosis of opportunistic viral infections caused by human cytomegalovirus (CMV), Epstein-Barr virus (EBV), human herpesvirus 6 (HHV-6), and BK virus (BKV), in comparison with “in-house” real-time PCR assays.
Patients and methods |
A total of 253 whole blood specimens obtained from transplant recipients were tested.
Results |
Both the “in-house” and the LC480 methods were highly correlated (Spearman correlation coefficient Rho≥0.85; p<0.0001) with an excellent overall qualitative agreement (90.5 %) and no significant quantitative difference between both techniques for the four viruses tested. The accuracy of the LC480 protocols were confirmed further by the results obtained with the 44 samples from the Quality Control for Molecular Diagnosis (QCMD) 2008 proficiency panel.
Conclusion |
The LC480 system constitutes a suitable and versatile real-time PCR platform in a routine laboratory setting for the diagnosis and monitoring of opportunistic viral infections in transplant recipients, by measuring HCMV, EBV, HHV-6, and BKV loads in whole blood samples.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : LightCycler® 480, Diagnostic virologique moléculaire, Charge virale, Sang total, Infections virales opportunistes
Keywords : LightCycler® 480 system, Viral molecular diagnosis, Viral load, Whole blood specimen, Opportunistic viral infections
Plan
Vol 58 - N° 2
P. 166-169 - avril 2010 Retour au numéro
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