L'allogreffe de cellules souches hématopoïétiques permet de guérir des hémopathies malignes et des maladies non malignes de la moelle osseuse ou du système immunitaire. Elle implique l'administration au receveur d'un conditionnement qui a pour but de détruire : son système immunitaire (pour prévenir le rejet de greffe) et, à un degré variable, un clone malin. Le conditionnement est suivi de l'injection du greffon de cellules souches hématopoïétiques. Dans ce greffon, les lymphocytes peuvent reconnaître et détruire les cellules tumorales résiduelles du receveur (effet du greffon contre la leucémie). Cette réaction explique l'intérêt de l'allogreffe dans les hémopathies malignes. Parallèlement, le système immunitaire du greffon peut être à l'origine de réactions délétères vis-à-vis des organes sains du receveur, c'est la réaction du greffon contre l'hôte. L'allogreffe de cellules souches hématopoïétiques s'accompagne d'une morbidité et d'une mortalité secondaires à la toxicité du conditionnement, à la réaction du greffon contre l'hôte et au déficit immunitaire postgreffe. L'incidence et la gravité de ces complications dépendent à la fois de paramètres propres au receveur (âge, statut de l'hémopathie) et des modalités de la greffe (type de conditionnement, compatibilité HLA [human leucocyte antigen] entre le donneur et le receveur, manipulation ex vivo du greffon, type de greffon). Le développement de nouvelles techniques et modalités de greffe a permis d'améliorer la survie des patients greffés et d'étendre les indications de greffe. Les principaux progrès concernent le développement des greffes à conditionnement réduit, des greffes de cellules souches périphériques ou de sang placentaire, l'amélioration des techniques de typage HLA dans les greffes non apparentées.