The aim of this study was to investigate the molecular epidemiology of Stenotrophomonas maltophilia strains responsible for respiratory infection in a neonatal intensive care unit (NICU) in Tunis City, isolated during 22 months (December 2003–September 2005).

Twelve strains of S. maltophilia isolated from tracheal aspirates of distinct infants and two environmental strains were tested for antibiotic susceptibility and genotyped by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) method.

Unlike a large heterogeneity demonstrated by the antibiotyping method, PFGE identified two concomitant outbreaks consisting of nine, including an environmental strain (clone A), and four strains (clone B), respectively; a distinguishable strain was classified in a unique pattern (PFGE type C). The long-term dissemination of these strains is a characteristic feature of these outbreaks. Improvement of hygienic conditions attributed to a markedly decrease in their isolation frequencies. Concomitant outbreaks and long period persistence of S. maltophilia in NICU is an important finding of this study.

Identification of two clonal strains of S. maltophilia responsible of respiratory infection. Epidemic strains are hardly eradicated when colonization is established.

Investigation moléculaire par électrophorèse en champs pulsés (ECP) de souches de Stenotrophomonas maltophilia responsables d’infections respiratoires chez des nouveaux-nés hospitalisés dans une unité de réanimation néonatale à Tunis, ces souches sont isolées durant une période de 22 mois (décembre 2003–septembre 2005).

Douze souches de S. maltophilia isolées de prélèvements trachéaux protégés et deux souches de l’environnement hospitalier ont été analysées par antibiogramme et électrophorèse en champs pulsé.

Contrairement à la forte hétérogénéité des profils de résistance aux antibiotiques de ces souches, la méthode de PFGE a pu mettre en évidence la présence de deux épidémies concomitantes (clone A et B). Le clone A a été représenté par neuf souches dont une souche environnementale, le clone B a été représenté par quatre souches, une souche de génotype C a été aussi identifiée. L’extension de la période de dissémination est une caractéristique de ces deux épidémies. L’amélioration des conditions d’hygiène a pu limiter la dissémination de ces souches sans éradication totale.

Identification de deux clones de S. maltophilia responsables d’infections respiratoires. Persistance de dissémination durant une longue période mettant en évidence la difficulté d’éradication de ce germe.