Modeling of the full-length Escherichia coli SeqA protein, in complex with DNA - 24/04/09
Analyse de la structure tridimensionnelle de SeqA, inhibiteur de l’initiation de la réplication chez Escherichia coli
, A. Chatti a, R. Hammami b, A. Landoulsi a
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Abstract |
The Escherichia coli SeqA protein, a negative regulator of chromosome DNA replication, prevents the overinitiation of replication within one cell cycle by binding to hemimethylated GATC sequences in the replication origin, oriC. In addition to the hemimethylated DNA-binding activity, the SeqA protein has a self-association activity, which is also considered to be essential for its regulatory function in replication initiation. To study the SeqA protein biological activity, we performed a SeqA protein model to examine its architecture. SeqA has a bipartite structure composed of a large and small lobe. The SeqA spatial conformation contributes to its ability to bind to a pair of hemimethylated GATC sequences and to its cooperative behavior.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Résumé |
La modélisation tridimensionnelle des sites actifs de la protéine SeqA, reconnue comme inhibiteur de l’initiation de la réplication chez Escherichia coli ainsi que plusieurs bactéries dont la réplication d’ADN est Dam méthylase dépendante, a permis d’éclaircir le mode d’action du système de régulation de l’initiation de la réplication de l’ADN bactérien et d’avoir une conception tridimensionnelle du mécanisme d’inhibition de l’initiation de la réplication de l’ADN bactérien.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Keywords : SeqA, GATC, Model, Methylation, oriC
Mots clés : SeqA, Site GATC, Modèle tertiaire, Méthylation, oriC
Plan
Vol 57 - N° 3
P. e61-e66 - mai 2009 Retour au numéro
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