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A short series of antidiabetic sulfonylureas exhibit multiple ligand PPARγ-binding patterns - 05/01/09

Doi : 10.1016/j.biopha.2007.12.007 
Alban Arrault a, Stéphane Rocchi b, Frédéric Picard c, Pierre Maurois d, Bernard Pirotte e, Joseph Vamecq f,
a Chemoinformatics Group, Institut de Chimie Organique et Analytique, UMR CNRS 6005, Université d'Orléans, BP 6759, F-45067 Orléans Cedex 2, France 
b Inserm U597, Faculté de Médecine, 28 Avenue de Valombrose, F-06107 Nice Cedex 2, France 
c Centre de recherche de l'Hôpital Laval local Y3106, 2725 chemin Sainte-Foy, Québec City, Québec, Canada G1V 4G5 
d CNRS UMR 8162, Centre Chirurgical Marie Lannelongue, F-92350 Le Plessis-Robinson, and Faculté de Pharmacie, Université Paris-Sud 11, F-92296 Châtenay-Malabry, France 
e Laboratoire de Chimie Pharmaceutique, Université de Liège, 1, Avenue de l'Hôpital, B-4000 Liège, Belgium 
f Inserm Univ 045131, EA1046, Pharmacologie, Faculté de Médecine, Pôle Recherche, Université de Lille 2, 1, Place de Verdun, F-59045 Lille Cedex, France 

Corresponding author. Tel.: +33 (0) 676 06 10 85; fax: +33 (0) 320 44 53 93.

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Abstract

The present work explores the PPARγ-activating properties of a series of eight sulfonylureas, using transfection experiments with 293T cells, and rosiglitazone as a reference PPARγ agonist. In the same time, results from these in vitro experiments are compared to those generated by a sound in silico PPARγ-ligand docking procedure combined to a simple and astute strategy analysis. The latter consists of building up a dendrogram (decision tree-like diagram) by applying three successive criteria, namely stability, conformational shape and H-binding strength of the docked sulfonylurea or rosiglitazone. This original dendrogram approach avers to be a successful way to account for our biochemical data. It discriminates also various PPARγ-binding patterns from our small series of compounds. The recognition of these patterns is extremely important because of the extraordinary potentialities of PPARγ ligands as therapeutic agents in diabetes, cancer, cardiovascular and neurological disorders.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Sulfonylureas, Rosiglitazone, PPARγ, Ligand binding domain, Molecular interactions, In silico studies, Docking, 2PRG structure, Selective PPAR modulation (SPPARM)

Abbreviations : PPAR, SPPARM, LBD, FMOC, GOLD, PDB, DMSO


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Vol 63 - N° 1

P. 56-62 - janvier 2009 Retour au numéro
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