Pseudomonas et apparentés - 24/11/08

Henri Monteil , a , Colette Harf-Monteil a
a Institut de bactériologie de la Faculté de médecine Hôpitaux universitaires de Strasbourg 3, rue Koeberlé 67000 Strasbourg, France 

Correspondance.

Résumé

Les bacilles à Gram négatif ne fermentant pas le glucose, autrefois regroupés pour beaucoup d'entre eux dans le genre Pseudomonas, sont répartis en plusieurs familles et genres. Leur position taxonomique, qui a subi de nombreux remaniements, est basée actuellement sur des données phénotypiques (caractères conventionnels ou nutritionnels) et génotypiques (composition en bases de l'ADN, hybridation ADN-ADN, séquençage de l'ARNr 16S).

Le diagnostic au laboratoire des genres Pseudomonas, Burkholderia, Pandoraea et Ralstonia — ainsi que des autres genres de bacilles à Gram négatif non fermentants apparentés (Stenotrophomonas, Massilia, Alcaligenes, Achromobacter, Ochrobactrum, Comamonas, Acidovorax, Psychrobacter, Brevundimonas, Agrobacterium, Sphingomonas, Shewanella, Methylobacterium, Roseomonas, Chryseobacterium, Empedobacter, Myroides, Bergeyella, Weeksella, Sphingobacterium, Oligella), classés en fonction de caractères d'orientation simples (oxydase, mobilité, production ou non d'indole) — est présenté sous forme de tableaux regroupant les caractères d'identification phénotypiques. Des systèmes d'identification commercialisés, ainsi que des systèmes automatisés, sont disponibles pour le diagnostic au laboratoire des bacilles à Gram négatif non fermentants, mais leur emploi doit s'appuyer sur une approche raisonnée, afin d'éviter des identifications pouvant s'avérer aberrantes.

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Abstract

Gram-negative nonfermenting rods have been for most of them initially accomodated in the genus Pseudomonas. Their taxonomic position has considerably changed as a result of successive genomic studies. They are now reclassified in new families and separate genera on the basis of phenotypic (growth parameters) and genotypic characteristics (% G+C content, DNA-DNA hybridization, 16S rRNA gene sequence analysis).

For identification in clinical laboratories, the following genera, Pseudomonas, Burkholderia, Pandoraea, Ralstonia, Stenotrophomonas, Massilia, Alcaligenes, Achromobacter, Ochrobactrum, Comamonas, Acidovorax, Psychrobacter, Brevundimonas, Agrobacterium, Sphingomonas, Shewanella, Methylobacterium, Roseomonas, Chryseobacterium, Empedobacter, Myroides, Bergeyella, Weeksella, Sphingobacterium and Oligella, are classified according to a simplified approach (oxidase reaction, motility, indole production) and are described in tables giving phenotypic characteristics and growth parameters.

Commercial and automatic systems are available for identification of Gram-negative nonfermenting rods, but suppose the determination of basic characters to avoid false identification.

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Mots-clé : Bacilles à Gram négatif non fermentants — taxonomie — diagnostic

Keywords : Gram-negative nonfermenting rods — taxonomy — identification


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Vol 2002 - N° 343

P. 31-40 - mai 2002 Retour au numéro
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