Identification of autoantibodies targets is of importance for both physiopathology discussion and analytical research with the recent development of multiplexing system like Luminex^® technology, built on flow cytometry or antigen biochip immunoassay. A new technique for antigen identification uses the proteomic analysis, which focuses on genes products, with their posttranslational modifications. Indeed, protein maturation can play an important role in epitopes generation. The purpose of this study is to review the main techniques for autoantigens identification, with a special development for the serological proteome analysis, combination of two-dimensional electrophoresis, immunoblotting assay, image analysis and mass spectrometry identification of interest immunoreactive spots. These techniques will be illustrated through identifications of the main autoantigens found in autoimmune hepatitis.

Identifier la cible antigénique des autoanticorps est fondamentale, tant dans un cadre physiopathologique qu’analytique avec l’émergence dans le champ de la sérologie auto-immune de méthodes à « haut débit » à travers la technologie Luminex^® ou les biopuces à antigènes. Un procédé récent d’identification de ces autoantigènes découle de l’analyse protéomique et permet d’appréhender les protéines telles qu’elles se présentent dans la cellule avec les modifications post-traductionnelles qui peuvent entrer dans la constitution des sites épitopiques. Cet article rapporte les différents moyens susceptibles d’être mis en œuvre pour identifier un autoantigène. Une importance particulière sera apportée à l’analyse sérologique du protéome, combinaison de l’électrophorèse bidimensionnelle, de l’immunoblot, d’une analyse d’image et enfin, d’une identification des antigènes cibles des autoanticorps par spectrométrie de masse. Ces différents procédés seront ensuite illustrés à travers l’identification des principaux autoantigènes rencontrés dans les hépatites auto-immunes.