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Profilage chimio-informatique des composés phytochimiques d'Azardirachta indica en tant qu'inhibiteurs oncogènes doubles SHP2/HSP90: identification du nimbocinol, de la nimbidinine et de la margolone - 10/04/25

Cheminformatic Profiling of Azardirachta indica Phytochemicals as Dual SHP2/HSP90 Oncogenic Inhibitors: Identification of Nimbocinol, Nimbidinin, and Margolone

Doi : 10.1016/j.pharma.2025.04.001 
Oluwaseun E. Agboola 1, 2, Zainab A. Ayinla 3, Oladayo Apalowo 4, Samuel S. Agboola 5, Omotola M. Fajana 1, Bidemi E. Ekundayo 1, 6, Babamotemi O. Itakorode 7, Babatunji E. Oyinloye 1, 6, 8,
1 Institut de recherche et développement sur les médicaments, Centre de recherche S. E. Bogoro, Université Afe Babalola, Ado-Ekiti, Nigéria 
2 Laboratoire scientifique et de recherche Damsem, Ado-Ekiti, Nigéria 
3 Département de biologie, Université de Waterloo, Ontario, Canada 
4 Département des sciences alimentaires, de la nutrition et de la promotion de la santé, Université d'État du Mississippi, Starkville, MS 39762, États-Unis 
5 Département de pharmacologie et de toxicologie, Université Afe Babalola, Ado-Ekiti, Nigéria 
6 Laboratoires de recherche en phytomédecine, toxicologie biochimique et biotechnologie, Département de biochimie, Faculté des sciences, Université Afe Babalola, PMB 5454, Ado-Ekiti 360001, Nigéria 
7 Département de biotechnologie, Université d'État d'Osun, Osogbo, Nigéria 
8 Groupe de biotechnologie et de biologie structurale (BSB), Département de biochimie et de microbiologie, Université de Zululand, KwaDlangezwa 3886, Afrique du Sud 

Correspondent:
Sous presse. Manuscrit accepté. Disponible en ligne depuis le Thursday 10 April 2025
Cet article a été publié dans un numéro de la revue, cliquez ici pour y accéder

[[[fr]]]Mot-clés: Composés dérivés du Neem Polypharmacologie Thérapie contre le cancer

[[[en]]]Keywords: Neem-derived compounds Polypharmacology Cancer therapeutics

Résumé

Le traitement du cancer est confronté à des défis en raison de la résistance aux médicaments et de la redondance des voies de signalisation. La double inhibition de SHP2 (région d'homologie Src 2 contenant le domaine phosphate-2) et HSP90 (protéine de choc thermique 90) offre une stratégie prometteuse pour surmonter ces limitations. Nous avons évalué les composés dérivés du neem par rapport à SHP2 (PDB ID : 5EHR) et HSP90 (PDB ID : 1YET) en utilisant l'amarrage moléculaire, le clustering hiérarchique et les analyses de similarité structurelle. La similarité médicamenteuse a été évaluée à l'aide de la règle de Lipinski de cinq, et les coefficients de similarité de Tanimoto ont été calculés. Le nimbocinol, la nimbidine et la margolone ont montré des affinités de liaison prometteuses aux deux cibles. Le nimbocinol a démontré une liaison supérieure à SHP2 (-10,463 kcal/mol) par rapport à SHP099 (-10,009 kcal/mol). La margolone a formé des interactions spécifiques, notamment un pont salin entre son groupe carboxylate et His100 dans HSP90. Tous les composés étaient conformes à la règle de Lipinski, la margolone présentant des similitudes structurelles avec la geldanamycine et SHP099. Cette étude identifie les composés dérivés du neem comme des inhibiteurs doubles potentiels de SHP2 et HSP90, ce qui représente un changement de paradigme dans la stratégie thérapeutique contre le cancer. Ces résultats fournissent une base pour le développement de nouvelles thérapies anticancéreuses multi-cibles.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

Cancer therapy faces challenges due to drug resistance and signalling pathway redundancy. Dual inhibition of SHP2 (Src homology region 2 domain-containing phosphate-2) and HSP90 (heat shock protein 90) offers a promising strategy to overcome these limitations.We evaluated neem- derived compounds against SHP2 (PDB ID: 5EHR) and HSP90 (PDB ID: 1YET) using molecular docking, hierarchical clustering, and structural similarity analyses. Drug-likeness was assessed using Lipinski's rule of five, and Tanimoto similarity coefficients were calculated Nimbocinol, nimbidin, and margolone showed promising binding affinities to both targets. Nimbocinol demonstrated superior binding to SHP2 (-10.463 kcal/mol) compared to SHP099 (-10.009 kcal/mol). Margolone formed specific interactions, including a salt bridge between its carboxylate group and His100 in HSP90. All compounds complied with Lipinski's rule, with margolone showing structural similarities to geldanamycin and SHP099.This study identifies neem-derived compounds as potential dual inhibitors of SHP2 and HSP90, presenting a paradigm shift in cancer therapeutic strategy. These findings provide a foundation for developing novel multi-targeted anticancer therapeutics.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

© 2025  Académie Nationale de Pharmacie. Publié par Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
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