Anomalies des transcrits: épissage et diagnostic - 04/01/25

Transcript abnormalities: splicing and diagnosis

Doi : 10.1016/S1773-035X(25)76273-5

Julie Amiot ^a,^b,⁎ , Claude Houdayer ^a,^b
^a Université Rouen Normandie, Inserm U1245, CHU Rouen, service de génétique, FHU G4 génomique, 37 boulevard Gambetta, 76000 Rouen, France
^b Association nationale des praticiens de génétique moléculaire (ANPGM), 123 boulevard de Port-Royal, 75014 Paris, France

^*Autrice correspondante.

Résumé

Plus nous étudions l’ARN, plus complexe il devient. En améliorant notre compréhension du paysage transcriptionnel, nous commençons à saisir que nous avons longtemps négligé un mécanisme génétique majeur en pathologie humaine. Le vaste répertoire de transcrits produits par le génome humain découle de mécanismes tels que l’épissage alternatif ou l’utilisation différentielle de promoteurs. Pour relever le nouveau défi d’interprétation à l’ère du séquençage haut débit, il est nécessaire d’améliorer la caractérisation des variations causales impactant l’ARN. Pour cela, plusieurs obstacles doivent être surmontés:

◗	prédire de manière sensible et précise l’impact des variants;
◗	obtenir des échantillons d’ARN pertinents et de bonne qualité;
◗	déployer les techniques adéquates pour évaluer qualitativement et quantitativement les transcrits.

Ainsi, une véritable expertise est requise pour interpréter correctement ces données.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

The more we study RNA, the more complex it becomes. As we try to understand our large transcriptional landscape, we begin to grasp how we may have long overlooked a major genetic disease-causing mechanism. The vast repertoire of RNA transcripts arises from mechanisms such as alternative splicing or differential promoter usage. To address the new interpretation challenge we face in the era of next generation sequencing, we must improve the characterization of disease-causing genomic variations impacting RNA. To do so, several challenges must be overcome:

◗	predicting accurately splicing variations;
◗	obtaining relevant and good quality RNA samples;
◗	deploying the proper techniques to evaluate transcripts qualitatively and quantitatively.

Therefore, in order to correctly interpret these data, expertise is required.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : ARN, diagnostic, transcrit, variant d’épissage, variant de signification incertaine

Keywords : diagnosis, RNA, splicing variation, transcript, variant of uncertain significance