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Laboratory practices for the diagnosis and management of mucormycosis in France, 2024 - 22/11/24

Doi : 10.1016/j.mycmed.2024.101520 
Laurence Millon a, , Françoise Botterel b, Julie Bonhomme c, Stéphane Valot d, Philippe Poirier e, Marie-Fleur Durieux f, Jeanne Bigot g, Guillaume Desoubeaux h, Adélaïde Chesnais h, Florent Morio i, Marc Pihet j, Kévin Brunet k, Anne-Pauline Bellanger a, Sébastien Imbert l, Gilles Nevez m, Solène Le Gal m, Nathalie Bourgeois n, Anne Debourgogne o, Marjorie Cornu p, Florence Persat q, Lilia Hasseine r, Marie-Elisabeth Bougnoux s, Sophie Brun t, Muriel Cornet u, Loïc Favennec v, Gilles Gargala v, Christine Bonnal w, Jean-Pierre Gangneux x, Alexandre Alanio y, Xavier Iriart z, aa, Caroline Mahinc ab, Taieb Chouaki ac, André Paugam ad, Valérie Letscher-Bru ae, Eric Dannaoui s,
a Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Jean Minjoz, UMR CNRS 6249, Université de Franche Comté, Besançon, France 
b Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Mondor, Créteil, France 
c Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Caen, ToxEMAC-ABTE, Normandie Université, UNICAEN, Caen, France 
d Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire de Dijon, Dijon, France 
e CHU Gabriel Montpied, Service de Parasitologie-Mycologie, 3IHP, Clermont-Ferrand, France 
f Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Dupuytren, Centre de Biologie et de Recherche en santé, Limoges, France 
g INSERM, Centre de Recherche St Antoine, CRSA, AP-HP, Hôpital Saint-Antoine, Sorbonne Université, Paris F-75012, France 
h Hôpital Universitaire Tours, Service de Parasitologie-Mycologie-Médecine Tropicale, Tours, France 
i CHU Nantes, Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité, UR1155, Nantes Université, Nantes, France 
j Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Angers, Angers, France 
k Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Poitiers, INSERM U1070, Université de Poitiers, France 
l Hôpital Universitaire de Bordeaux, Service de Parasitologie-Mycologie, Bordeaux, France 
m Infections Respiratoires Fongiques (IRF), CHU de Brest, Université Angers, University of Brest, Brest, France 
n Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire de Montpellier, Montpellier, France 
o Laboratoire de Microbiologie, CHRU de Nancy, Hôpitaux de Brabois, 11 allée du Morvan, 54511 Vandœuvre-les-Nancy, France 
p Laboratoire Parasitologie-Mycologie, INSERM U1285, CHU Lille, CNRS, UMR 8576 - UGSF - Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle, Université de Lille, Lille F-59000, France 
q Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hospices Civils de Lyon, Institut des Agents Infectieux Lyon 1, Lyon, France 
r Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire de Nice, Nice, France 
s Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Hôpital Universitaire Necker, Unité de Parasitologie-Mycologie, Service de Microbiologie, Paris, France 
t Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Avicenne, AP-HP, Bobigny, France 
u TIMC-IMAG, CNRS, CHU Grenoble Alpes, Grenoble INP, Université Grenoble Alpes, Grenoble 38000, France 
v Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire de Rouen, Rouen, France 
w Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Bichat, Paris, France 
x Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Rennes, Rennes, France 
y Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Saint-Louis, Paris, France 
z Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Service de Parasitologie-Mycologie, Toulouse 31059, France 
aa Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (UMR “Infinity”, INSERM/CNRS/Université de Toulouse III), Toulouse 31024, France 
ab Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire de Saint-Etienne, Saint-Etienne, France 
ac Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Amiens, Amiens, France 
ad Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire de Cochin, Paris, France 
ae Hôpitaux Universitaires de Strasbourg -Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale, Université de Strasbourg - UR 3073 Pathogens-Host-Arthropods-Vectors Interactions, France 

Corresponding authors.

Abstract

This study investigates the diagnostic practices for mucormycosis among 30 French University Hospital mycology laboratories, in 2024. All laboratories perform both direct examination and culture, with fluorescent brighteners being the most commonly used method for direct examination. While 77 % of the participating laboratories routinely identify Mucorales to the species level, with 70 % having adopted Mucorales-specific quantitative PCR, primarily for the diagnosis of invasive fungal infections. Antifungal susceptibility testing practices varied between centers, with 36.7 % of laboratories consistently performing these tests, primarily using gradient concentration strips. Amphotericin B, posaconazole, and isavuconazole were the most frequently tested antifungals. These findings highlight variations in laboratory practices and emphasize the importance of establishing uniform diagnostic and susceptibility testing methods to optimize mucormycosis management.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Laboratory practice, Mucormycosis, Mucorales


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