Slim Fourati, ProfPhD a, b, c, ⁎ , Alawiya Reslan, PhD d, e, Jérome Bourret, PhD e, Jean-Sébastien Casalegno, MD f, Yannis Rahou d, e, Lionel Chollet, MD g, Sylvie Pillet, PhD h, Pauline Tremeaux, PhD i, Nefert Candace Dossou, PharmD j, Elyanne Gault, ProfPhD d, k, Maud Salmona, PhD l, Berthe-Marie Imbert-Marcille, ProfPhD m, Audrey Mirand, PhD n, Sylvie Larrat, PhD o, Alice Moisan, PhD p, Stéphane Marot, PhD q, Aurélie Schnuriger, PhD r, Nicolas Veyrenche, PhD s, Ilka Engelmann, MD t, Lynda Handala, PhD u, Amandine Henry, PharmD v, Valentin Stephan, PharmD w, Ségolène Brichler, PhD x, Véronique Avettand-Fenoel, ProfPhD y, Nael Zemali, MD z, Caroline Lefeuvre, PharmD aa, Charlotte Pronier, PhD ab, Luc Deroche, PharmD ac, Marie-Christine Jaffar-Bandjee, PhD ad, Lina Mouna, PhD ae, Catherine Francois af, Alexandre Regueme, PharmD ag, Cédric Hartard, PhD ah, Sylvie Rogez, ProfPhD ai, Floriane Gallais, PhD aj, Arnaud Ly a, Christophe Rodriguez, ProfPhD a, b, c, Georges Dos Santos, PhD ak, Etienne Simon-Loriere, PhD al, Olivier Schwartz, ProfPhD am, Julian Buchrieser, PhD am, Jean-MiIchel Pawlotsky, ProfPhD a, b, c, Frédéric Lemoine, PhD e, an, Etienne Audureau, PhD b, ao, Marie-Anne Rameix-Welti, Prof k, ⁎
on behalf of the POLYRES investigators†
Investigators listed at the end of the Article
Naël Zemali, Sonia Burrel, Alice Moisan, Zakasoa-Mbololona Zavaoarisaina, Romain Legros, Boris Derman, Vincent Pargny, Hortense Petat, Jean-Christophe Plantier, Véronique Avettand-Fenoel, Salim Ferrani, Jérome Guinard, Clémence Guillaume, Gilbert Mchantaf, Victoria Marie, Laurent Bret, Fabien Lesne, Anthony de Oliveira, Alexandre Regueme, Kazali Alidjinou, Lionel Chollet, Vincent Gardan, Ségolène Brichler, Loic de Pontual, Camille Aupiais, Stéphane Marot, Aurélie Schnuriger, Marine Perrier, Pierre Jatteau, Djeneba Fofana, Théophile Cocherie, Elisa Teyssou, Cathia Soulié, Vincent Calvez, Sylvie Larrat, Anne Faisant, Guillaume Mortamet, Caroline Tournegros, Mohamed Habib, Sylvie Pillet, Aymeric Cantais, Franck Zekre, Thomas Bourlet, Oulfa Boussetta-Charfi, Sara Chenafi-Adham, Eva Gleizes, Cédric Hartard, Caroline Lefeuvre, Elise Bouthry, Lina Mouna, Fairly Warnakulasuriya, Quentin Le Hingrat, Marie-Christine Jaffar, Diana Heaugwane, Benjamin Azemar, Nicolas Mnemosyme, Laurent Souply, Catherine François, Sandrine Castelain, Cinthia Rames, Arnaud Bécourt, Ilka Engelmann, Eric Jeziorski, Vincent Foulongne, Steven Henry, Léa Domitien, Lynda Handala, Catherine Gaudy-Graffin, Agathe Crémadés, Amandine Henry, Alessandra Pennisi, Maud Salmona, Jérôme Le Goff, Sarah Mafi, Audrey Gabassi, Marie-Laure Néré, Stéphane Bonacorsi, Naim Ouldali, Senhaji Rachik Abdeljalil, Marie-Anne Rameix-Welti, Alawyia Reslan, Yannis Rahou, Jérome Bourret, Frédérique Lemoine, Kévin Da Silva, Samar Berreira Ibraim, Emilie Yab, Vincent Enouf, Flora Donati, Matthieu Prot, Banujaa Jeyarajah, Etienne Simon-Loriere, Nefert Candace Dossou, Astrid Vabret, Slim Fourati, Christophe Rodriguez, Jean-Michel Pawlotsky, Pierre Cappy, Alexandre Soulier, Mohamed Ader, Sarah Seng, Arnaud Ly, Pierre-André Natella, Etienne Audureau, Georges Dos Santos, Laurence Fagour, Anne-Julie Schapira, Olivier Flechelles, Luc Deroche, Nicolas Leveque, Claire Morton Fauche, Berthe-Marie Imbert, Louise Castain, Audreay Rodallec, Justine Sourice, Christele Gras-le Guen, Anne Chauvire-Drouard, Elyanne Gault, Frédérique Moreau, Claire Deback, Floriane Gallais, Morgane Solis, Valentin Stephan, Léa Pilorgé, Sophie Vallet, Léa Gaitan, Sylvie Rogez, Audrey Mirand, Cecile Henquell, Charlotte Pronier, Vincent Thibault, Pauline Trémeaux, Isabelle Claudet, Mélanie Pucelle, Laetitia Staes, Camille Vellas, Romain Carcenac, Nicolas Veyrenche, Jean-sébastien Casalegno, Alexandre Gaymard, Jose Kombou, Antonin Bal, Stanislas Ogoudjobi
a Department of Virology, Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, AP-HP, Créteil, France
b Université Paris-Est-Créteil, Créteil, France
c INSERM U955, Team Viruses, Hepatology, Cancer, Créteil, France
d M3P, UMR 1173 (2I), INSERM, Université de Versailles St Quentin, Université Paris Saclay, Paris, France
e M3P Centre National de Référence Virus des Infections Respiratoire Institut Pasteur Université Paris Cité, Paris, France
f Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Centre de Biologie et Pathologie Nord, Hôpital de la Croix-Rousse, Hospices Civils de Lyon, Lyon France, France
g Laboratoire de Biologie Médicale Centre Hospitalier Intercommunal de Toulon, Toulon, France
h Service des Agents Infectieux et d’Hygiène-Plateau de Biologie Hôpital Nord-CHU de Saint-Etienne, France, Saint-Etienne, France
i Laboratoire de Virologie, CHU Toulouse, France, Toulouse France, France
j Normandie, INSERM, Normandie Univ, DYNAMICURE UMR1311, CHU Caen, Department of Virology, Caen, France
k Virology Department, Hôpital Ambroise Paré, Paris, France
l Virology Department, Hôpital Saint Louis, INSIGHT U976, INSERM, Université Paris-Cité, Paris, France
m Virology department, CHU de Nantes, Nantes, France
n Virology Department, CHU de Clermont-Ferrand, Clermond-Ferrand, France
o Université Grenoble Alpes, Laboratoire de Virologie, Institut de Biologie-Pathologie, Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes, Grenoble, France
p Université Rouen Normandie, Université de Caen Normandie, INSERM, Normandie Université, DYNAMICURE UMR 1311, CHU Rouen, Department of Virology, Rouen, France
q Sorbonne Université; APHP Virologie Pitié-Salpêtrière, Paris Ile de France, France
r Sorbonne Université, APHP Virologie St Antoine, Tenon, Trousseau, Paris Ile de France, France
s Virology Department, Hôpital Necker, Enfants Malades, Paris, France
t Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections, Université Montpellier, INSERM, Établissement Français du Sang, CHU Montpellier, Montpellier, France
u Virology Unit, Department of Bacteriology, Virology and Hospital Hygiene, University Hospital of Tours, Tours, France
v Laboratoire de Biologie Médicale, Microbiologie, CH Victor Dupouy, Argenteuil, France
w Virology Department, CHRU de Brest, Brest, France
x Service de Microbiologie Clinique, CHU Avicenne, AP-HP, Bobigny, Bobigny, France
y CHU Orléans, Virologie, Orléans, France
z CHU de Bordeaux, Service de Virologie, Bordeaux, France
aa Laboratoire de Virologie, CHU Angers, Angers, France
ab Virology Department, CHU de Rennes, Rennes, France
ac Virology Department, CHU de Poitiers, Poitiers, France
ad CNR Associé des Virus Respiratoires, laboratoire Microbiologie, Hôpital Félix Guyon CHU Réunion, La Réunion, France
ae Virology Department, Hôpital Paul Brousse, INSERM U1193, AP-HP, Université Paris Saclay, Paris, France
af Laboratoire de Virologie, Centre de Biologie Humaine-CHU Amiens, Université Picardie Jules Verne, Amiens, France
ag Université Lille, CHU de Lille, Laboratoire de Virologie ULR3610, Lille, France
ah Laboratoire de Virologie, CHRU de Nancy Brabois, Université de LorraineVandœuvre-lès-Nancy, France
ai Virology Department, CHU de Limoges, Limoges, France
aj Virology Department, CHU de Strasbourg, Strasbourg, France
ak Microbiology Department CHU de Martinique, La Martinique, France
al Evolutionary Genomics of RNA Viruses, Institut Pasteur, Université Paris Cité, Paris, France
am Virus and Immunity Unit, Institut Pasteur, Université Paris Cité, Paris, France
an Bioinformatics and Biostatistics Hub, Institut Pasteur, Université Paris Cité, Paris, France
ao Clinical Research Unit Mondor, Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, AP-HP, IMRB INSERM U955, Team CEpiA, Créteil, France