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Incidental pulmonary nodules: Natural language processing analysis of radiology reports - 04/09/24

Doi : 10.1016/j.resmer.2024.101136 
Emmanuel Grolleau a, b, , Sébastien Couraud a, b, c, Emilien Jupin Delevaux a, d, Céline Piegay e, Adeline Mansuy d, Julie de Bermont b, François Cotton a, d, f, Jean-Baptiste Pialat a, d, f, François Talbot g, Loïc Boussel a, d, f
a University of Lyon, Claude Bernard University, 43 boulevard du 11 Novembre 1918, 69100 Villeurbanne, France 
b Acute Respiratory Disease and Thoracic Oncology Department, Lyon Sud Hospital, Hospices Civils de Lyon, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69495 Oullins-Pierre-Bénite, France 
c EMR-3738 Therapeutic Targeting in Oncology, Lyon Sud Hospital, Hospices Civils de Lyon, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69495 Oullins-Pierre-Bénite, France 
d Radiology department, Hospices Civils de Lyon, 3 quai des Célestins, 69002 Lyon, France 
e Département d'Information Médicale, Lyon Sud Hospital, Hospices Civils de Lyon, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69495 Oullins-Pierre-Bénite, France 
f CREATIS, UMR 5220 - INSERM U630, 7 Avenue Jean Capelle, 69621 Villeurbanne, France 
g Department of Information Technology, Hospices Civils de Lyon, 3 quai des Célestins, 69002 Lyon, France 

Corresponding author.

Abstract

Background

Pulmonary nodules are a common incidental finding on chest Computed Tomography scans (CT), most of the time outside of lung cancer screening (LCS). We aimed to evaluate the number of incidental pulmonary nodules (IPN) found in 1 year in our hospital, as well as the follow-up (FUP) rate and the clinical and radiological features associated with FUP.

Methods

We trained a Natural Language Processing (NLP) tool to identify the transcripts mentioning the presence of a pulmonary nodule, among a large population of patients from a French hospital. We extracted nodule characteristics using keyword analysis. NLP algorithm accuracy was determined through manual reading from a sample of our population. Electronic health database and medical record analysis by clinician allowed us to obtain information about FUP and cancer diagnoses.

Results

In this retrospective observational study, we analyzed 101,703 transcripts corresponding to the entire CTs performed in 2020. We identified 1,991 (2 %) patients with an IPN. NLP accuracy for nodule detection in CT reports was 99 %. Only 41 % received a FUP between January 2020 and December 2021. Patient age, nodule size, and the mention of the nodule in the impression part were positively associated with FUP, while nodules diagnosed in the context of COVID-19 were less followed. 36 (2 %) lung cancers were subsequently diagnosed, with 16 (45 %) at a non-metastatic stage.

Conclusions

We identified a high prevalence of IPN with a low FUP rate, encouraging the implementation of IPN management program. We also highlighted the potential of NLP for database analysis in clinical research.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Incidental pulmonary nodule, Natural language processing, Artificial intelligence, Radiology reports, Follow-up

Abbreviations : IPN, FUP, NLP, BERT, HCL


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